More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_7210 on replicon NC_011981
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011981  Avi_7210  monooxygenase  100 
 
 
444 aa  904    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3877  monooxygenase  54.79 
 
 
441 aa  498  1e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.229544 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1592  monooxygenase  55.91 
 
 
521 aa  486  1e-136  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.147927 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3795  FMNH2-utilizing oxygenase  55.35 
 
 
458 aa  485  1e-136  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.216468  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2017  putative FMNH2-utilizing oxygenase  53.99 
 
 
455 aa  484  1e-135  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0632006  normal  0.1646 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4352  monooxygenase  54.14 
 
 
471 aa  479  1e-134  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6191  monooxygenase  57.82 
 
 
428 aa  478  1e-133  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0618693  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1983  fmnh2-utilizing oxygenase  55.56 
 
 
448 aa  473  1e-132  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.105914  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3486  putative oxygenase  51.82 
 
 
451 aa  468  1.0000000000000001e-131  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.242923  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34700  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  53.39 
 
 
469 aa  463  1e-129  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.339029  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0931  putative nitrilotriacetate monoxygenase, component A  44.8 
 
 
442 aa  361  1e-98  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.027595  normal  0.0155722 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0294  putative monooxygenase  43.5 
 
 
475 aa  346  4e-94  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3904  putative oxygenase  41.69 
 
 
460 aa  338  9.999999999999999e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02230  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  41.67 
 
 
458 aa  338  1.9999999999999998e-91  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3704  putative monooxygenase  41.5 
 
 
457 aa  326  6e-88  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4330  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  39.96 
 
 
457 aa  287  2.9999999999999996e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1266  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  39.43 
 
 
457 aa  286  4e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.476784  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7232  xenobiotic (desulfurization)monooxygenase subunit A  38.24 
 
 
458 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177104  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2100  putative xenobiotic (desulfurization)monooxygenase subunit A, NtaA/SnaA/SoxA/DszA family  39.25 
 
 
457 aa  281  2e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2156  xenobiotic (desulfurization)monooxygenase subunit A  38.18 
 
 
458 aa  280  3e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2352  nitrilotriacetate monooxygenase, A subunit, putative  42.7 
 
 
434 aa  279  8e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.742121  normal  0.6128 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0150  putative monooxygenase  38.02 
 
 
445 aa  274  3e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.323467 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2773  xenobiotic (desulfurization)monooxygenase subunit A  37.64 
 
 
452 aa  273  3e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0251  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  37.75 
 
 
439 aa  273  5.000000000000001e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.441756 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22400  xenobiotic compound monooxygenase, DszA family, A subunit protein  37.66 
 
 
453 aa  272  7e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1381  xenobiotic compound DszA family monooxygenase  37.74 
 
 
440 aa  272  1e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.559516  normal  0.652987 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3188  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  37.33 
 
 
446 aa  269  7e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1849  nitrilotriacetate monooxygenase component A  37.67 
 
 
452 aa  268  2e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.896869  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4737  nitrilotriacetate monooxygenase component A  37.83 
 
 
441 aa  265  1e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2175  nitrilotriacetate monooxygenase component A  37.81 
 
 
445 aa  263  3e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2378  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  36.34 
 
 
440 aa  263  4e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0906  nitrilotriacetate monooxygenase component A  38.58 
 
 
441 aa  262  8e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.457793  normal  0.708091 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4142  monooxygenase-like  38.82 
 
 
454 aa  261  2e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.279616  normal  0.0146609 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1851  nitrilotriacetate monooxygenase component A  38.06 
 
 
452 aa  261  2e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1773  putative nitrilotriacetate monooxygenase component A protein  37.56 
 
 
448 aa  260  3e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.702307  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2361  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  34.29 
 
 
441 aa  260  3e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.43651  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4825  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  35.59 
 
 
441 aa  259  9e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0349  xenobiotic compound monooxygenase, DszA family, A subunit  35.59 
 
 
441 aa  258  1e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7195  monooxygenase  39.25 
 
 
443 aa  258  2e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0485069  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21890  monooxygenase, NtaA/SnaA/SoxA family  37.61 
 
 
443 aa  256  5e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3332  putative monooxygenase  36 
 
 
451 aa  256  6e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21740  xenobiotic compound monooxygenase, DszA family, A subunit  36.61 
 
 
442 aa  256  6e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.77772  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2176  nitrilotriacetate monooxygenase component A  37.03 
 
 
445 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.699045 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0105  nitrilotriacetate monooxygenase component A  37.05 
 
 
448 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00568077 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3452  putative monooxygenase  34.74 
 
 
447 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000752171 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2425  monooxygenase, NtaA/SnaA/SoxA family  35.23 
 
 
448 aa  253  3e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.109543  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2676  nitrilotriacetate monooxygenase component A (NtA monooxygenase component A) (NtA-MO A)  36.9 
 
 
448 aa  253  5.000000000000001e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2535  NtaA/SnaA/SoxA family monooxygenase  35.79 
 
 
444 aa  253  5.000000000000001e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.354477  normal  0.017296 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1853  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  35.98 
 
 
456 aa  252  1e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21660  monooxygenase, NtaA/SnaA/SoxA family  36.94 
 
 
441 aa  251  2e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.714961  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0118  putative monooxygenase  35.82 
 
 
445 aa  251  2e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4213  putative nitrilotriacetate monooxygenase component A protein  37.44 
 
 
449 aa  250  3e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21340  xenobiotic compound monooxygenase, DszA family, A subunit  35.96 
 
 
450 aa  250  4e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.341615  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6152  nitrilotriacetate monooxygenase protein, component A  36.64 
 
 
444 aa  249  5e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0293921  hitchhiker  0.000273361 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5093  NtaA/SnaA/SoxA family monooxygenase  35.56 
 
 
445 aa  246  4e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2090  hypothetical protein  35.2 
 
 
438 aa  247  4e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.59319  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5298  Nrd protein  36.6 
 
 
461 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0826228  normal  0.019429 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0408  hypothetical protein  35.21 
 
 
458 aa  246  4.9999999999999997e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2211  NtaA/SnaA/SoxA family monooxygenase  34.57 
 
 
448 aa  246  6e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.284835  normal  0.969738 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1172  NtaA/SnaA/SoxA family monooxygenase  36.16 
 
 
451 aa  245  9.999999999999999e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.259723  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6386  monooxygenase protein  35.48 
 
 
450 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0181294  normal  0.0362961 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5007  NtaA/SnaA/SoxA family monooxygenase  37.06 
 
 
442 aa  244  1.9999999999999999e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.643407  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2024  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  34.76 
 
 
460 aa  244  3e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2515  putative nitrilotriacetate monooxygenase, component A  35.73 
 
 
435 aa  244  3e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.261163 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1908  putative xenobiotic (desulfurization)monooxygenase subunit A, NtaA/SnaA/SoxA/DszA family  36.43 
 
 
454 aa  243  3.9999999999999997e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.504324  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2568  nitrilotriacetate monooxygenase component A (NtA monooxygenase component A) (NtA-MO A)  35.75 
 
 
447 aa  243  5e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5176  monooxygenase  34.98 
 
 
429 aa  242  1e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3282  nitrilotriacetate monooxygenase component A  37.44 
 
 
459 aa  241  1e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4542  putative monooxygenase protein  35.02 
 
 
450 aa  242  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0938197 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3891  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  36.08 
 
 
439 aa  241  2e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.68944  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4857  nitrilotriacetate monooxygenase component A  33.18 
 
 
449 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.140464  normal  0.511595 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8274  monooxygenase  35.86 
 
 
442 aa  240  4e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.104481 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1187  hypothetical protein  36.67 
 
 
441 aa  239  9e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4521  monooxygenase-like protein  35.03 
 
 
455 aa  238  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.81326 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3292  nitrilotriacetate monooxygenase component A  36.57 
 
 
447 aa  238  2e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.451548  normal  0.084467 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43950  monoxygenase, NtaA/DszA family  35.25 
 
 
448 aa  237  3e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.182023  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0770  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  35.56 
 
 
450 aa  237  3e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0433  monooxygenase  35.66 
 
 
472 aa  237  3e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.744526  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0526  hypothetical protein  35.03 
 
 
451 aa  236  5.0000000000000005e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2149  hypothetical protein  33.48 
 
 
442 aa  236  6e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3435  Nrd protein  36.06 
 
 
444 aa  236  7e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.218631 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4104  NtaA/SnaA/SoxA family monooxygenase  35.07 
 
 
478 aa  236  7e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.958651 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2489  hypothetical protein  33.18 
 
 
442 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6404  nitrilotriacetate monooxygenase component A  34.48 
 
 
457 aa  233  5e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0247936  normal  0.261136 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3116  Nrd protein  35.62 
 
 
444 aa  233  6e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.554502 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3218  NtaA/SnaA/SoxA family monooxygenase  34.95 
 
 
439 aa  233  7.000000000000001e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0232  putative monooxygenase  33.04 
 
 
438 aa  233  7.000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3311  Nrd protein  35.84 
 
 
457 aa  232  1e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05546  Putative C2H2 finger domain transcription factor (Eurofung)  35.19 
 
 
1121 aa  231  3e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3782  nitrilotriacetate monooxygenase  36.3 
 
 
455 aa  231  3e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1300  putative nitrilotriacetate monooxygenase  35.19 
 
 
451 aa  230  3e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0896409  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2658  NtaA/SnaA/SoxA family monooxygenase  34.99 
 
 
439 aa  230  5e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.104132  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1693  putative monooxygenase  35.49 
 
 
449 aa  228  2e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0841245  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0268  putative nitrilotriacetate monooxygenase component A  35.56 
 
 
448 aa  228  2e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2364  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  36.88 
 
 
445 aa  228  2e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5125  putative monooxygenase protein  35.56 
 
 
450 aa  227  4e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1126  nitrilotriacetate monooxygenase component A  34.28 
 
 
453 aa  226  5.0000000000000005e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2295  nitrilotriacetate monooxygenase component A  33.26 
 
 
449 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3283  nitrilotriacetate monooxygenase component A (NtA monooxygenase component A) (NtA-MO A)  33.41 
 
 
474 aa  226  7e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2409  hypothetical protein  36.51 
 
 
454 aa  226  8e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>