18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_1544 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_1544  hypothetical protein  100 
 
 		 311 aa  630  1e-180  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1069  phosphoesterase PA-phosphatase related  47.75 
 
 		 233 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000430937 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1213  phosphoesterase PA-phosphatase related  43.97 
 
 		 257 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0707655  hitchhiker  0.00000433977 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3624  phosphoesterase, PA-phosphatase related  30.3 
 
 		 262 aa  88.6  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.56667  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2804  phosphoesterase, PA-phosphatase related  31.31 
 
 		 262 aa  87.4  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1769  NADH:ubiquinone oxidoreductase, Na(+)-translocating, F subunit  32.23 
 
 		 227 aa  82.8  0.000000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0165224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0398  phosphoesterase PA-phosphatase related  26.24 
 
 		 259 aa  80.1  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0239  hypothetical protein  31.09 
 
 		 261 aa  79  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2014  phosphoesterase, PA-phosphatase related  29.9 
 
 		 281 aa  79  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0712  phosphoesterase, PA-phosphatase related  29.59 
 
 		 258 aa  77  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.991586 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3073  phosphoesterase, PA-phosphatase related  34.6 
 
 		 239 aa  75.9  0.0000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.0000522612  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0091  phosphoesterase, PA-phosphatase related  28.29 
 
 		 262 aa  75.1  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.412824 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3479  phosphoesterase, PA-phosphatase related  38.39 
 
 		 255 aa  73.9  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.320308 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0032  phosphoesterase, PA-phosphatase related  29.63 
 
 		 260 aa  62  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2078  phosphoesterase, PA-phosphatase related  33.64 
 
 		 223 aa  58.9  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3625  phosphoesterase PA-phosphatase related  37.11 
 
 		 262 aa  50.8  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00395759 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2814  phosphoesterase PA-phosphatase related  27.63 
 
 		 238 aa  47.8  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000029245  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2570  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  29.52 
 
 		 209 aa  43.5  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.501729  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>