32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_1247 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_1247  hypothetical protein  100 
 
 		 117 aa  239  1e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0093  hypothetical protein  64.13 
 
 		 106 aa  125  3e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.531483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5429  protein of unknown function UPF0153  53.06 
 
 		 106 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0259414  hitchhiker  0.00694306 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7105  hypothetical protein  52.63 
 
 		 106 aa  110  9e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2209  hypothetical protein  53.19 
 
 		 108 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3596  hypothetical protein  50 
 
 		 108 aa  107  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.167839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1919  protein of unknown function UPF0153  50.53 
 
 		 110 aa  107  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.54208  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1698  hypothetical protein  51.58 
 
 		 118 aa  105  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.319534 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0028  protein of unknown function UPF0153  52.87 
 
 		 100 aa  79.3  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186945  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0025  hypothetical protein  50.57 
 
 		 104 aa  73.9  0.0000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0233008 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3008  hypothetical protein  33.33 
 
 		 103 aa  67  0.00000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1450  protein of unknown function UPF0153  39.22 
 
 		 102 aa  62.4  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1365  hypothetical protein  35.45 
 
 		 361 aa  59.3  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.493188  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2436  protein of unknown function UPF0153  37.14 
 
 		 108 aa  59.3  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1159  hypothetical protein  34.26 
 
 		 108 aa  53.9  0.0000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.122155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2174  hypothetical protein  34.31 
 
 		 141 aa  50.4  0.000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.592421  normal  0.594741 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2432  protein of unknown function UPF0153  31.68 
 
 		 116 aa  50.4  0.000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3004  hypothetical protein  31.68 
 
 		 114 aa  50.1  0.000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0398  protein of unknown function UPF0153  34.82 
 
 		 131 aa  48.9  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1595  ferredoxin  30.39 
 
 		 134 aa  44.3  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.640546 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1866  ferredoxin  30.39 
 
 		 134 aa  44.7  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.354364  normal  0.828444 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1923  ferredoxin  30.39 
 
 		 134 aa  44.3  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135966 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1860  ferredoxin  30.39 
 
 		 134 aa  44.3  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1827  hypothetical protein  33.04 
 
 		 123 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.889307 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1253  hypothetical protein  30.97 
 
 		 117 aa  42.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.579212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2884  hypothetical protein  35.8 
 
 		 117 aa  42.7  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000156715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1413  hypothetical protein  30.39 
 
 		 134 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.504066  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1999  hypothetical protein  29.41 
 
 		 134 aa  42  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0842  hypothetical protein  30.7 
 
 		 127 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0802023  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0819  hypothetical protein  30.7 
 
 		 127 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0818071  normal  0.417746 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0856  hypothetical protein  31.13 
 
 		 127 aa  40.4  0.008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0169  protein of unknown function UPF0153  30.39 
 
 		 141 aa  40  0.009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>