19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0348 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_0348  hypothetical protein  100 
 
 		 195 aa  401  1e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.236028  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4589  Phosphoglycerate mutase  67.88 
 
 		 193 aa  279  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.177325 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4326  Phosphoglycerate mutase  66.32 
 
 		 193 aa  275  3e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3541  phosphoglycerate mutase  67.88 
 
 		 199 aa  261  3e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0356  phosphoglycerate mutase  54.79 
 
 		 244 aa  170  2e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.111547  normal  0.767481 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3524  phosphoglycerate mutase  50 
 
 		 191 aa  162  3e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3544  phosphoglycerate mutase  50.79 
 
 		 237 aa  162  4.0000000000000004e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.977141  normal  0.359428 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2641  Phosphoglycerate mutase  47.62 
 
 		 211 aa  159  2e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0780  phosphoglycerate mutase  45.7 
 
 		 190 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4091  phosphoglycerate mutase  33.1 
 
 		 227 aa  48.1  0.00008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0229  fructose-2,6-bisphosphatase  28.23 
 
 		 223 aa  45.4  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1977  Phosphoglycerate mutase  28.68 
 
 		 190 aa  44.7  0.0008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00635412  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4794  phosphoglycerate mutase  24.81 
 
 		 184 aa  44.7  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1007  phosphoglycerate mutase  23.84 
 
 		 241 aa  43.5  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5351  phosphoglycerate mutase  28.03 
 
 		 203 aa  43.1  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5058  phosphoglycerate mutase  28.03 
 
 		 203 aa  43.1  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.639819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4970  phosphoglycerate mutase  28.03 
 
 		 203 aa  43.1  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5604  phosphoglycerate mutase  26.95 
 
 		 202 aa  42  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.335394  normal  0.959562 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1203  phosphoglycerate mutase  24.82 
 
 		 203 aa  41.6  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>