39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_R0028 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012034  Athe_R0028  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000000248442  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0028  tRNA-Thr  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000383633  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2731  tRNA-Thr  90.41 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.264397  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2417  tRNA-Thr  90.41 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000618371  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0088  tRNA-Thr  89.71 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140728  hitchhiker  0.00708611 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0043  tRNA-Thr  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000011951  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0045  tRNA-Thr  85.53 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0775671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0034  tRNA-Thr  85.71 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.88486  normal  0.49295 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0057  tRNA-Thr  84.21 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Thr-2  tRNA-Thr  84.21 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0010  tRNA-Thr  84.21 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0535352  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0011  tRNA-Thr  94.29 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000691484  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0012  tRNA-Thr  89.36 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000603563  normal  0.0893983 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0038  tRNA-Thr  90.48 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0025  tRNA-Thr  84.06 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.821281  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0012  tRNA-Thr  86.79 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0026  tRNA-Thr  82.89 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25090  tRNA-Asp  96.43 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.657176  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0065  tRNA-Thr  82.89 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00337548 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0018  tRNA-Thr  82.89 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000226987  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0065  tRNA-Gly  88.46 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.109951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0007  tRNA-Thr  82.89 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.22668  hitchhiker  0.0000658151 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0013  tRNA-Thr  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000000622484  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0013  tRNA-Thr  82.89 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0563085  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0006  tRNA-Thr  87.23 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000288516  hitchhiker  0.0000067546 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0026  tRNA-Val  85.45 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0001  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0029  tRNA-Thr  87.23 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.217954 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1871  tRNA-Thr  87.23 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0184728  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0020  tRNA-Thr  83.33 
 
 		 78 bp  46.1  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000056123  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0041  tRNA-Glu  93.55 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000102386  normal  0.397694 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15520  tRNA-Gly  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00156661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15490  tRNA-Gly  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0014086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0317  tRNA-Thr  87.23 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000144022  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0310  tRNA-Thr  87.23 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00278593  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0080  tRNA-Thr  89.47 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0207378  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0028  tRNA-Thr  84.48 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000154592  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0087  tRNA-Val  83.87 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1179  tRNA-Asp  96.15 
 
 		 79 bp  44.1  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.015483  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>