65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Moth_R0088 on replicon NC_007644
Organism: Moorella thermoacetica ATCC 39073



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007644  Moth_R0088  tRNA-Thr  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140728  hitchhiker  0.00708611 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0028  tRNA-Thr  98.28 
 
 
76 bp  107  4e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000383633  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0088  tRNA-Thr  91.94 
 
 
76 bp  83.8  0.000000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000142546  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0025  tRNA-Thr  91.94 
 
 
76 bp  83.8  0.000000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000257059  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0028  tRNA-Thr  89.71 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000000248442  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2417  tRNA-Thr  92.86 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000618371  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2731  tRNA-Thr  92.86 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.264397  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Thr-2  tRNA-Thr  88 
 
 
76 bp  77.8  0.0000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00332161  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0035  tRNA-Thr  88 
 
 
76 bp  77.8  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0436953  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0016  tRNA-Thr  86.67 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.35256e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0025  tRNA-Thr  86.67 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.821281  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0026  tRNA-Thr  85.33 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0080  tRNA-Thr  91.49 
 
 
73 bp  61.9  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0207378  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0061  tRNA-Thr  85.33 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00680264  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0017  tRNA-Thr  85.33 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.79728  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0013  tRNA-Thr  85.33 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000000622484  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0007  tRNA-Thr  85.33 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.22668  hitchhiker  0.0000658151 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0042  tRNA-Thr  85.33 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000011183  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0065  tRNA-Thr  85.33 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00337548 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0039  tRNA-Thr  87.1 
 
 
76 bp  60  0.00000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000296877  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0054  tRNA-Thr  87.1 
 
 
76 bp  60  0.00000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000041401  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0012  tRNA-Thr  91.3 
 
 
75 bp  60  0.00000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000603563  normal  0.0893983 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0038  tRNA-Thr  94.74 
 
 
77 bp  60  0.00000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0043  tRNA-Thr  85.29 
 
 
76 bp  56  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000011951  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0014  tRNA-Thr  85.29 
 
 
76 bp  56  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000000293663  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0020  tRNA-Thr  85.71 
 
 
78 bp  54  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000056123  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0006  tRNA-Thr  84 
 
 
76 bp  54  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000288516  hitchhiker  0.0000067546 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0310  tRNA-Thr  84 
 
 
76 bp  54  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00278593  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0317  tRNA-Thr  84 
 
 
76 bp  54  0.000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000144022  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0011  tRNA-Thr  85.33 
 
 
75 bp  54  0.000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000691484  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Thr-2  tRNA-Thr  84 
 
 
76 bp  54  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1871  tRNA-Thr  84 
 
 
76 bp  54  0.000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0184728  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0010  tRNA-Thr  84 
 
 
76 bp  54  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0535352  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0070  tRNA-Thr  86.79 
 
 
76 bp  50.1  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0034  tRNA-Thr  85.51 
 
 
77 bp  50.1  0.00007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.88486  normal  0.49295 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0030  tRNA-Thr  85 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0003  tRNA-Thr  85 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000292995  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0062  tRNA-Thr  86.54 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0033  tRNA-Thr  85 
 
 
73 bp  48.1  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0010  tRNA-Thr  83.33 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000114274  hitchhiker  0.00000872087 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0052  tRNA-Thr  83.82 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000639553  hitchhiker  0.00795761 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_R0007  tRNA-Thr  85.71 
 
 
73 bp  48.1  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.9458700000000003e-24  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0009  tRNA-Thr  85.71 
 
 
73 bp  48.1  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.365782  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0004  tRNA-Thr  82.67 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.166563  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0015  tRNA-Thr  86.44 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000141414  hitchhiker  0.00853262 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0001  tRNA-Thr  82.67 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0045  tRNA-Thr  91.43 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000137446  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5648  tRNA-Thr  91.18 
 
 
73 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000000502297  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Thr-3  tRNA-Thr  91.18 
 
 
76 bp  44.1  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000633532  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Thr-5  tRNA-Thr  91.18 
 
 
76 bp  44.1  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000184905  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0045  tRNA-Thr  86.96 
 
 
76 bp  44.1  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0775671  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0168  tRNA-Thr  91.18 
 
 
76 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00852327 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07727  tRNA-Thr  88.1 
 
 
72 bp  44.1  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Thr-3  tRNA-Thr  91.18 
 
 
76 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000222462  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0027  tRNA-Thr  85.19 
 
 
73 bp  44.1  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.997139  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5147  tRNA-Thr  91.18 
 
 
76 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000364084  normal  0.477803 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5651  tRNA-Thr  91.18 
 
 
76 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0000701056  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Thr-1  tRNA-Thr  91.18 
 
 
73 bp  44.1  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000186681  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0189  tRNA-Thr  91.18 
 
 
76 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000000579129  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0023  tRNA-Thr  85.19 
 
 
73 bp  44.1  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0027  tRNA-Thr  85.19 
 
 
73 bp  44.1  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tThr01  tRNA-Thr  85.19 
 
 
79 bp  44.1  0.005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000000642788  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0034  tRNA-Thr  91.18 
 
 
73 bp  44.1  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.175686  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0034  tRNA-Thr  91.18 
 
 
73 bp  44.1  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000453984  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0020  tRNA-Thr  85.19 
 
 
76 bp  44.1  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0148448 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>