18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0448 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_0448  hypothetical protein  100 
 
 
112 aa  224  2e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0927  hypothetical protein  82.14 
 
 
117 aa  190  7e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.160123  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2965  hypothetical protein  75.44 
 
 
114 aa  172  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0991  hypothetical protein  69.31 
 
 
141 aa  145  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0626666 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2958  hypothetical protein  61.95 
 
 
113 aa  114  6e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.348765  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2090  YCII-related protein  46.73 
 
 
115 aa  101  3e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.484825  normal  0.775433 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0970  DGPFAETKE family protein  43.7 
 
 
118 aa  72.4  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.188687  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0010  YCII-related protein  42.48 
 
 
119 aa  65.9  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2593  YCII-related protein  32.79 
 
 
121 aa  55.8  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1555  YCII-related  31.58 
 
 
118 aa  53.9  0.0000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00194658  normal  0.0318419 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4084  YCII-related protein  37.18 
 
 
118 aa  44.7  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.304074 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14340  hypothetical protein  33.68 
 
 
119 aa  43.9  0.0007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.143905  normal  0.239735 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3072  DGPFAETKE domain-containing protein  35.63 
 
 
117 aa  43.5  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0396  DGPFAETKE family protein  30.77 
 
 
120 aa  42  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0813  YCII-related protein  33.33 
 
 
120 aa  42  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5826  hypothetical protein  34.62 
 
 
139 aa  40.8  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.924088  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1754  YCII-related protein  28.7 
 
 
116 aa  40.8  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.261368  normal  0.926785 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3350  DGPFAETKE family protein  30.51 
 
 
113 aa  40.8  0.007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.154704  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>