10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0567 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_0567  hypothetical protein  100 
 
 		 309 aa  615  1e-175  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.633626  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3723  Beta-lactamase class A-like  27.27 
 
 		 255 aa  53.9  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000939313  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1388  putative beta-lactamase  28.86 
 
 		 259 aa  53.5  0.000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1202  beta-lactamase, putative  28.86 
 
 		 259 aa  53.5  0.000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.291582  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0280  Beta-lactamase  22.46 
 
 		 353 aa  49.3  0.00008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1147  putative beta-lactamase  23.53 
 
 		 423 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1712  beta-lactamase  29.41 
 
 		 576 aa  45.8  0.0009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4436  beta-lactamase class A-like protein  25.79 
 
 		 293 aa  44.3  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0101027  normal  0.450402 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2092  penicillin-binding protein, transpeptidase  27.05 
 
 		 424 aa  43.5  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00783255  hitchhiker  0.00000266476 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3876  beta-lactamase  25 
 
 		 468 aa  43.5  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0589748 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>