213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_1204 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013203  Apar_1204  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  100 
 
 
122 aa  257  5.0000000000000005e-68  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10470  lactoylglutathione lyase-like lyase  81.97 
 
 
122 aa  220  4e-57  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000146284 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2217  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  62.5 
 
 
125 aa  172  1.9999999999999998e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.505264  normal  0.196245 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4885  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  44.26 
 
 
126 aa  113  7.999999999999999e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000885753  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0745  lactoylglutathione lyase, putative  45.45 
 
 
132 aa  108  4.0000000000000004e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0307  hypothetical protein  42.98 
 
 
124 aa  100  9e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0469  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  40.16 
 
 
120 aa  94.7  4e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2070  hypothetical protein  42.86 
 
 
131 aa  87.4  7e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.765991  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0506  lactoylglutathione lyase-like protein  38.71 
 
 
126 aa  81.3  0.000000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0056  glyoxalase family protein  37.6 
 
 
131 aa  76.6  0.00000000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0056  glyoxalase family protein  37.3 
 
 
131 aa  76.6  0.0000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.471593  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0062  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  39.68 
 
 
131 aa  76.3  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.799398  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1387  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.89 
 
 
131 aa  76.3  0.0000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.94622  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2242  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.4 
 
 
131 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1491  glyoxalase I/lactoylglutathione lyase  40.32 
 
 
131 aa  74.7  0.0000000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.111293  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3968  hypothetical protein  38.46 
 
 
131 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.139383  normal  0.13084 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0440  lactoylglutathione lyase  33.33 
 
 
126 aa  73.9  0.0000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.281062  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0141  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.71 
 
 
131 aa  73.6  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0516272 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3237  lactoylglutathione lyase  39.2 
 
 
131 aa  73.6  0.0000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4708  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.92 
 
 
131 aa  73.2  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.148195  normal  0.0502587 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0449  lactoylglutathione lyase  33.33 
 
 
126 aa  72.4  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00132524  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3974  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  39.2 
 
 
131 aa  72.4  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0147  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.65 
 
 
131 aa  71.2  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1478  lactoylglutathione lyase  37.7 
 
 
130 aa  69.7  0.00000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0459895  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0969  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.11 
 
 
139 aa  67.8  0.00000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.387103  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2200  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.92 
 
 
126 aa  67.4  0.00000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.335588  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1643  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.21 
 
 
131 aa  67.4  0.00000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.201281 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4804  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.71 
 
 
131 aa  67.4  0.00000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.114931  normal  0.177904 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3204  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  39.2 
 
 
131 aa  66.6  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.868887  normal  0.107987 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0524  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.51 
 
 
133 aa  66.2  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3783  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.21 
 
 
131 aa  65.9  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.553638 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5815  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.3 
 
 
131 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4287  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.33 
 
 
131 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2724  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.58 
 
 
132 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4654  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.33 
 
 
131 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.186376 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1399  putative lactoylglutathione lyase  31.82 
 
 
132 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2289  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.4 
 
 
131 aa  61.6  0.000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.713044  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5251  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.51 
 
 
131 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00319801 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1049  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.71 
 
 
131 aa  60.8  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.464949  normal  0.0262279 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0364  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.4 
 
 
126 aa  60.8  0.000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.276612  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4478  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.07 
 
 
132 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.613578 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03060  hypothetical protein  33.59 
 
 
131 aa  60.8  0.000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2191  lactoylglutathione lyase  31.36 
 
 
139 aa  60.5  0.000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.195451  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1536  glyoxalase I  35.48 
 
 
131 aa  60.1  0.00000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002900  lactoylglutathione lyase  28.12 
 
 
131 aa  60.1  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.796352  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3968  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.2 
 
 
149 aa  58.5  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.477474  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0739  glyoxalase I  32.03 
 
 
132 aa  58.2  0.00000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.871991  normal  0.556357 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1707  putative lactoylglutathione lyase  35.77 
 
 
121 aa  58.2  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.318443 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0511  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.33 
 
 
146 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0741132 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2366  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.33 
 
 
146 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00659372 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0165  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.16 
 
 
142 aa  56.6  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0300216  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0440  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.33 
 
 
146 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.676404 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0566  lactoylglutathione lyase  31.5 
 
 
135 aa  55.8  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4172  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.5 
 
 
140 aa  55.5  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0402  lactoylglutathione lyase  31.5 
 
 
135 aa  55.8  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.69151  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3401  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.5 
 
 
146 aa  55.5  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.356805  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0169  lactoylglutathione lyase  33.07 
 
 
137 aa  56.2  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2384  lactoylglutathione lyase  33.06 
 
 
135 aa  55.8  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0115374  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19190  lactoylglutathione lyase  31.75 
 
 
129 aa  55.5  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2668  lactoylglutathione lyase  33.06 
 
 
135 aa  55.1  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000837248  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0474  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.54 
 
 
146 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.459342  normal  0.516309 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0531  lactoylglutathione lyase  33.07 
 
 
138 aa  54.7  0.0000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000101735  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2567  lactoylglutathione lyase  30.71 
 
 
135 aa  53.9  0.0000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000056884  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1869  lactoylglutathione lyase  30.71 
 
 
135 aa  54.3  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.189976  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0401  lactoylglutathione lyase  29.46 
 
 
128 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.742989  normal  0.222386 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1760  lactoylglutathione lyase  30.71 
 
 
135 aa  54.3  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000424118  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0502  lactoylglutathione lyase (glyoxalase I)  32.28 
 
 
136 aa  54.3  0.0000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2791  lactoylglutathione lyase  31.25 
 
 
138 aa  54.3  0.0000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1648  lactoylglutathione lyase  34.65 
 
 
130 aa  53.9  0.0000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.137836  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1477  lactoylglutathione lyase  32.26 
 
 
136 aa  53.5  0.0000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1623  lactoylglutathione lyase  30 
 
 
130 aa  53.5  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.0000216677  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2915  lactoylglutathione lyase  32.81 
 
 
132 aa  53.5  0.0000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.401625 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0685  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.95 
 
 
146 aa  53.5  0.0000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.858158  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0211  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.23 
 
 
122 aa  53.5  0.0000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.188471 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2466  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.56 
 
 
146 aa  53.5  0.0000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1450  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.86 
 
 
146 aa  53.1  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0582503  hitchhiker  0.000352028 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0152  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.28 
 
 
146 aa  53.1  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0386322  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3368  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.83 
 
 
135 aa  53.5  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.278611  normal  0.261907 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1395  lactoylglutathione lyase  33.86 
 
 
130 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.55095 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01621  glyoxalase I, Ni-dependent  30.23 
 
 
135 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00282129  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1989  lactoylglutathione lyase  30.23 
 
 
135 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000656309  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1978  glyoxalase I  30.23 
 
 
135 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.077498  hitchhiker  0.00100198 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1547  glyoxalase I  30.23 
 
 
135 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.726295  normal  0.763196 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2625  glyoxalase I  31.01 
 
 
129 aa  52.4  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.738569  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2545  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.93 
 
 
140 aa  52.4  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.029939 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2363  glyoxalase I  30.23 
 
 
135 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0314391  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1870  lactoylglutathione lyase  29.69 
 
 
138 aa  52.8  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3939  lactoylglutathione lyase  29.92 
 
 
158 aa  52.4  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0338387  normal  0.236164 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0199  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.33 
 
 
146 aa  52.4  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.616516 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2098  lactoylglutathione lyase  30.16 
 
 
128 aa  52.4  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.913757  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01611  hypothetical protein  30.23 
 
 
135 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00318347  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2984  lactoylglutathione lyase  30.65 
 
 
136 aa  52.8  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.150551  normal  0.040699 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2047  lactoylglutathione lyase  29.69 
 
 
138 aa  52.8  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.050639  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06791  glyoxalase I  31.75 
 
 
129 aa  52.4  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0508996  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1728  glyoxalase I  30.23 
 
 
135 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1229  lactoylglutathione lyase  31.5 
 
 
173 aa  51.6  0.000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.958125  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1182  lactoylglutathione lyase  32.28 
 
 
128 aa  51.6  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1739  glyoxalase I  30.23 
 
 
135 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00795001  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1734  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.13 
 
 
146 aa  51.6  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3491  lactoylglutathione lyase  32.03 
 
 
142 aa  52  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>