More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0463 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0463  peptidase M24  100 
 
 		 374 aa  775    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00525602  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07860  Xaa-Pro aminopeptidase  45.19 
 
 		 374 aa  315  9.999999999999999e-85  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00623606 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2546  peptidase M24  43.51 
 
 		 388 aa  303  2.0000000000000002e-81  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.874302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05170  Xaa-Pro aminopeptidase  43.4 
 
 		 379 aa  283  2.0000000000000002e-75  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1717  aminopeptidase P; XAA-pro aminopeptidase  36.54 
 
 		 353 aa  238  2e-61  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.338445  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1522  peptidase M24  34.62 
 
 		 354 aa  233  3e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06140  peptidase M24  36.81 
 
 		 356 aa  233  5e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1051  peptidase M24  36.91 
 
 		 357 aa  230  3e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000093282  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0848  peptidase M24  36.54 
 
 		 359 aa  229  7e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00339348  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4328  X-Pro dipeptidase  35.54 
 
 		 353 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4308  X-Pro dipeptidase  35.99 
 
 		 353 aa  226  6e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4271  proline dipeptidase  35.54 
 
 		 353 aa  226  7e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4102  proline dipeptidase  35.71 
 
 		 353 aa  225  1e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0184718  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3940  proline dipeptidase, Xaa-Pro dipeptidase  35.71 
 
 		 353 aa  224  1e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4422  proline dipeptidase  35.71 
 
 		 353 aa  225  1e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4218  X-Pro dipeptidase  35.71 
 
 		 353 aa  225  1e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3951  proline dipeptidase, Xaa-Pro dipeptidase  35.99 
 
 		 353 aa  224  2e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00282404  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4051  peptidase M24  35.44 
 
 		 353 aa  224  2e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1718  peptidase M24  35.54 
 
 		 357 aa  224  3e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0561234 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2340  peptidase M24  36.36 
 
 		 353 aa  222  9e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1539  peptidase M24  37.06 
 
 		 359 aa  222  9.999999999999999e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0730424 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0926  X-Pro dipeptidase  35.44 
 
 		 353 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2892  peptidase M24  35.54 
 
 		 353 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0628939  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0232  peptidase M24  35.26 
 
 		 353 aa  219  5e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0719  aminopeptidase P  33.42 
 
 		 352 aa  218  1e-55  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00721866  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2530  peptidase M24  36.18 
 
 		 353 aa  217  2e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0202219  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0903  peptidase M24  38.14 
 
 		 359 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0118243  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1321  peptidase M24  36.64 
 
 		 356 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.182533  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0881  peptidase M24  37.82 
 
 		 359 aa  216  4e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000469831  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1659  peptidase M24  35.56 
 
 		 369 aa  215  9.999999999999999e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0650  peptidase M24  33.88 
 
 		 363 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3924  putative X-Pro dipeptidase  39.79 
 
 		 356 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3975  putative X-Pro dipeptidase  44.26 
 
 		 356 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3727  proline dipeptidase  36.39 
 
 		 356 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4014  proline dipeptidase  36.39 
 
 		 356 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.832696  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2944  peptidase M24  37.5 
 
 		 360 aa  213  5.999999999999999e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000942293  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3890  putative X-Pro dipeptidase  36.09 
 
 		 356 aa  212  7e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000130814 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3617  proline dipeptidase  36.09 
 
 		 356 aa  212  1e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.338254  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3635  proline dipeptidase  44.68 
 
 		 356 aa  212  1e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2591  peptidase M24  46.98 
 
 		 362 aa  210  3e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.653697  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1268  putative X-Pro dipeptidase  44.26 
 
 		 356 aa  210  4e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3921  proline dipeptidase, putative  43.83 
 
 		 356 aa  209  5e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3699  peptidase M24  44.26 
 
 		 356 aa  209  6e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.602043  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1389  peptidase M24  40.13 
 
 		 354 aa  207  3e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.793398  normal  0.128657 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl379  Xaa-Pro-dipeptidase  33.43 
 
 		 357 aa  206  8e-52  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0116957  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0715  M24 family metallopeptidase  34.08 
 
 		 362 aa  204  2e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.775303  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0269  peptidase M24  37.58 
 
 		 371 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.106169 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2035  peptidase M24  33.62 
 
 		 347 aa  200  3e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.232424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5250  peptidase M24  36.87 
 
 		 365 aa  199  5e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1588  peptidase M24  31.61 
 
 		 353 aa  199  7e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0608501  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1621  peptidase M24  31.61 
 
 		 353 aa  199  7e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0238018  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0299  peptidase M24  33.33 
 
 		 355 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.987373  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1324  aminopeptidase P  33.79 
 
 		 364 aa  198  1.0000000000000001e-49  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.152178  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1358  peptidase M24  33.15 
 
 		 347 aa  197  2.0000000000000003e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0476908  normal  0.192427 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1697  peptidase M24  38.91 
 
 		 354 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2852  proline dipeptidase, putative  44.67 
 
 		 358 aa  196  4.0000000000000005e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.164066  normal  0.067191 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2754  aminopeptidase  43.11 
 
 		 361 aa  196  7e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0674  peptidase M24  31.89 
 
 		 359 aa  195  9e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02295  predicted peptidase  43.11 
 
 		 361 aa  195  1e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02256  hypothetical protein  43.11 
 
 		 361 aa  195  1e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0480  peptidase M24  36.59 
 
 		 371 aa  195  1e-48  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1094  proline dipeptidase  30.25 
 
 		 353 aa  194  2e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1284  aminopeptidase  43.11 
 
 		 361 aa  194  2e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.836873 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2522  aminopeptidase  43.11 
 
 		 361 aa  194  2e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0248  peptidase M24  42.54 
 
 		 366 aa  194  2e-48  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1272  peptidase M24  43.11 
 
 		 361 aa  194  3e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2537  aminopeptidase  36.56 
 
 		 361 aa  193  3e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2675  aminopeptidase  43.11 
 
 		 361 aa  194  3e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1454  putative Xaa-Pro aminopeptidase  29.75 
 
 		 360 aa  193  4e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.156054  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2694  peptidase M24  32.69 
 
 		 357 aa  193  4e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.88591 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0341  Xaa-Pro peptidase  38.89 
 
 		 358 aa  191  2e-47  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0636047  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_622  Xaa-Pro aminopeptidase  32.87 
 
 		 362 aa  191  2e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2656  peptidase M24  33.52 
 
 		 356 aa  191  2e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000248617 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1004  peptidase M24  36.34 
 
 		 357 aa  191  2e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4284  peptidase M24  40.46 
 
 		 393 aa  191  2e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.37732 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3617  aminopeptidase  35.94 
 
 		 361 aa  189  5.999999999999999e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0169  peptidase M24  34.97 
 
 		 372 aa  189  9e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.871292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15500  Xaa-Pro aminopeptidase  42.06 
 
 		 364 aa  189  9e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.615325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4452  peptidase M24  34.65 
 
 		 373 aa  187  2e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0539466  hitchhiker  0.000000869693 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1036  peptidase M24  34.16 
 
 		 354 aa  186  8e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.660933  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1560  peptidase M24  34.25 
 
 		 356 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0956578  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2021  xaa-pro dipeptidase  36.39 
 
 		 355 aa  184  3e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.812333  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0334  peptidase M24  37.23 
 
 		 360 aa  183  4.0000000000000006e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1001  peptidase M24  41.63 
 
 		 366 aa  183  5.0000000000000004e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.895593  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0397  peptidase M24  34.69 
 
 		 357 aa  183  5.0000000000000004e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1087  peptidase M24  34.55 
 
 		 348 aa  182  6e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.338834 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2392  peptidase M24  46.94 
 
 		 379 aa  180  4e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.782382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0545  aminopeptidase P  33.86 
 
 		 357 aa  180  4e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.723004  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1188  peptidase M24  29.97 
 
 		 358 aa  180  4e-44  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00256362  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4725  peptidase M24  37.5 
 
 		 361 aa  179  5.999999999999999e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.28239  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1271  proline dipeptidase  40.44 
 
 		 351 aa  179  8e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6603  peptidase M24  33.33 
 
 		 373 aa  179  8e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1813  proline dipeptidase  35.42 
 
 		 362 aa  179  8e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.136171  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0678  dipeptidase  34.97 
 
 		 361 aa  179  1e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1764  peptidase M24  39.29 
 
 		 351 aa  178  2e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2332  peptidase M24  43.04 
 
 		 376 aa  177  2e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0415611  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1798  peptidase M24  39.29 
 
 		 351 aa  178  2e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0197  peptidase M24  32.22 
 
 		 376 aa  177  2e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.307422  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0547  peptidase M24  33.43 
 
 		 356 aa  177  3e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.600524  normal  0.382783 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0632  peptidase M24  39.39 
 
 		 364 aa  176  5e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>