15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6899 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6899  hypothetical protein  100 
 
 		 258 aa  513  1.0000000000000001e-145  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38140  hypothetical protein  60.24 
 
 		 259 aa  265  5e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6402  hypothetical protein  39.3 
 
 		 268 aa  150  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.577893  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1531  hypothetical protein  36.14 
 
 		 254 aa  128  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.460343  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6866  hypothetical protein  35.18 
 
 		 272 aa  122  6e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.592244  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4520  hypothetical protein  36.25 
 
 		 259 aa  102  7e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00166177  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6218  hypothetical protein  31.95 
 
 		 256 aa  88.6  8e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6816  hypothetical protein  26.95 
 
 		 266 aa  75.1  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.701031  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35660  hypothetical protein  30.15 
 
 		 275 aa  73.2  0.000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.335426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35670  hypothetical protein  30.08 
 
 		 263 aa  70.1  0.00000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.222488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2190  hypothetical protein  30.19 
 
 		 264 aa  65.9  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0151  hypothetical protein  32.23 
 
 		 252 aa  65.1  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24990  hypothetical protein  27.95 
 
 		 254 aa  63.2  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01430  hypothetical protein  25.98 
 
 		 261 aa  62  0.000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0268047 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01870  hypothetical protein  29.32 
 
 		 262 aa  55.1  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>