15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6218 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6218  hypothetical protein  100 
 
 		 256 aa  500  1e-141  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35660  hypothetical protein  34.69 
 
 		 275 aa  118  7.999999999999999e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.335426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6866  hypothetical protein  31.91 
 
 		 272 aa  103  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.592244  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35670  hypothetical protein  33.83 
 
 		 263 aa  98.6  9e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.222488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0151  hypothetical protein  30.77 
 
 		 252 aa  92.4  6e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6899  hypothetical protein  31.95 
 
 		 258 aa  91.3  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6816  hypothetical protein  32.17 
 
 		 266 aa  89.4  5e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.701031  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01430  hypothetical protein  29.53 
 
 		 261 aa  88.2  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0268047 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24990  hypothetical protein  32.54 
 
 		 254 aa  88.2  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38140  hypothetical protein  33.72 
 
 		 259 aa  87.4  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6402  hypothetical protein  30.2 
 
 		 268 aa  82.8  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.577893  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1531  hypothetical protein  29.92 
 
 		 254 aa  82.4  0.000000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.460343  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01870  hypothetical protein  32.58 
 
 		 262 aa  75.1  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4520  hypothetical protein  33.21 
 
 		 259 aa  73.6  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00166177  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2190  hypothetical protein  25.57 
 
 		 264 aa  43.1  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>