More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3679 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_3679  condensation domain protein  100 
 
 
602 aa  1191    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7311  peptide synthetase  36.83 
 
 
2183 aa  311  2.9999999999999997e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4099  non-ribosomal peptide synthase  34.19 
 
 
2033 aa  276  7e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.908444 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5871  amino acid adenylation domain protein  32.57 
 
 
1078 aa  275  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.126486 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3094  amino acid adenylation domain protein  33.41 
 
 
3086 aa  271  2.9999999999999997e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.54199 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1748  amino acid adenylation domain protein  39.45 
 
 
7712 aa  269  1e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.970061 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6472  amino acid adenylation domain-containing protein  38.57 
 
 
3176 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.173269 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3027  amino acid adenylation domain protein  33.18 
 
 
3086 aa  268  2.9999999999999995e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1089  putative non-ribosomal peptide synthase  34.77 
 
 
5467 aa  267  4e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.993162 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5750  amino acid adenylation domain protein  35.12 
 
 
1454 aa  267  5e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2462  linear gramicidin synthetase subunit D  34.43 
 
 
2156 aa  264  4e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2874  non-ribosomal peptide synthase  34.43 
 
 
2156 aa  264  4e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1878  condensation domain-containing protein  33.19 
 
 
479 aa  263  4.999999999999999e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4588  amino acid adenylation domain protein  34.05 
 
 
1925 aa  263  8e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5618  amino acid adenylation domain-containing protein  31.49 
 
 
2156 aa  261  3e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2859  peptide synthase  35.65 
 
 
4991 aa  260  4e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5617  amino acid adenylation domain-containing protein  32.72 
 
 
4968 aa  260  6e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1846  peptide synthase  38.05 
 
 
4502 aa  259  1e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4219  non-ribosomal siderophore peptide synthetase  34.26 
 
 
3470 aa  258  3e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4083  amino acid adenylation domain-containing protein  32.17 
 
 
3942 aa  257  4e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.223479 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1875  amino acid adenylation domain-containing protein  32.26 
 
 
1990 aa  257  4e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1859  amino acid adenylation domain-containing protein  36.84 
 
 
2596 aa  255  1.0000000000000001e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3701  non-ribosomal peptide synthase  34.94 
 
 
3962 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0007  condensation domain-containing protein  29.92 
 
 
798 aa  254  3e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.441594  normal  0.0181415 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5752  amino acid adenylation domain protein  31.01 
 
 
1069 aa  254  4.0000000000000004e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6473  amino acid adenylation domain-containing protein  36.21 
 
 
3018 aa  250  4e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0194792 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2873  bacitracin synthetase 1  31.15 
 
 
4960 aa  250  6e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2858  peptide synthase  38.3 
 
 
4136 aa  248  2e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3468  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  36.84 
 
 
7541 aa  248  3e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.247204 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1829  amino acid adenylation  32.1 
 
 
4037 aa  248  3e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3091  amino acid adenylation domain protein  32.64 
 
 
1870 aa  246  6.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2463  bacitracin synthetase 1  30.94 
 
 
4960 aa  246  9e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3030  amino acid adenylation domain protein  32.49 
 
 
1870 aa  246  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4039  amino acid adenylation domain-containing protein  37.83 
 
 
3224 aa  244  3e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25570  peptide synthase  37.16 
 
 
5213 aa  243  7.999999999999999e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2092  amino acid adenylation domain-containing protein  33.33 
 
 
1661 aa  241  2e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6557  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  38.34 
 
 
2320 aa  239  9e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000475071 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4307  amino acid adenylation domain protein  38.79 
 
 
3247 aa  238  2e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.39871 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25560  Non-ribosomal peptide synthase, PvdD-like protein  36.22 
 
 
2878 aa  236  6e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1674  amino acid adenylation domain-containing protein  35.34 
 
 
5230 aa  236  6e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25580  peptide synthase  36.22 
 
 
4747 aa  236  9e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1861  amino acid adenylation domain protein  32.95 
 
 
2571 aa  234  3e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1835  amino acid adenylation domain protein  32.95 
 
 
2571 aa  234  3e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4085  amino acid adenylation domain-containing protein  35.92 
 
 
2606 aa  234  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3066  MCP methyltransferase, CheR-type  31.75 
 
 
4483 aa  233  6e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1887  amino acid adenylation domain protein  37.36 
 
 
2614 aa  233  7.000000000000001e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2150  pyoverdine sidechain peptide synthetase IV, D-Asp-L-Ser component  34 
 
 
2875 aa  233  9e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2870  amino acid adenylation domain-containing protein  36.03 
 
 
3231 aa  232  1e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.812927 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1845  peptide synthase  35.36 
 
 
5654 aa  232  2e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4220  non-ribosomal peptide synthetase  34.54 
 
 
2628 aa  231  3e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.663079 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1888  amino acid adenylation domain protein  35.57 
 
 
1315 aa  231  4e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0349547  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3454  amino acid adenylation domain protein  38.17 
 
 
1339 aa  230  6e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0624608  decreased coverage  0.0000000205264 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2574  amino acid adenylation domain-containing protein  27.87 
 
 
6404 aa  228  3e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1784  amino acid adenylation domain-containing protein  31.77 
 
 
4080 aa  226  8e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33610  peptide synthase  36.3 
 
 
5149 aa  226  1e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.844682 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1861  amino acid adenylation domain-containing protein  34.04 
 
 
2883 aa  225  2e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1960  non-ribosomal peptide synthase:amino acid adenylation  34.02 
 
 
2883 aa  225  2e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.77716 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6558  non-ribosomal peptide synthase  38.15 
 
 
4106 aa  225  2e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00138815 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1613  non-ribosomal peptide synthase  31.54 
 
 
3498 aa  224  4.9999999999999996e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0181375 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4072  amino acid adenylation domain protein  36.94 
 
 
3230 aa  223  7e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.753138 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0288  putative non-ribosomal peptide synthetase  36.83 
 
 
3294 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0873  putative non-ribosomal peptide synthetase  36.83 
 
 
3294 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1625  putative non-ribosomal peptide synthetase  36.83 
 
 
3297 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0842979  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2461  amino acid adenylation  37.36 
 
 
4606 aa  220  7e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.782467 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18420  amino acid adenylation enzyme/thioester reductase family protein  35.76 
 
 
2365 aa  220  7e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25650  peptide synthase  33.96 
 
 
4318 aa  220  7e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0525  non-ribosomal peptide synthase  36.45 
 
 
3180 aa  219  1e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2460  amino acid adenylation  37.73 
 
 
2605 aa  218  2e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.441641  normal  0.494441 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2148  pyoverdine sidechain peptide synthetase II, D-Asp-L-Thr component  33.02 
 
 
2625 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.307821  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2086  putative siderophore related no-ribosomal peptide synthase  36.77 
 
 
3287 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1927  putative siderophore non-ribosomal peptide synthetase MbaJ  36.77 
 
 
3290 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1942  putative siderophore non-ribosomal peptide synthetase MbaJ  36.77 
 
 
3290 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3071  amino acid adenylation domain protein  30.69 
 
 
3291 aa  218  4e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2829  peptide synthase  33.18 
 
 
4342 aa  218  4e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3743  amino acid adenylation domain protein  36.71 
 
 
2626 aa  218  4e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2135  pyoverdine chromophore precursor synthetase  33.87 
 
 
4336 aa  217  5e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0024  linear gramicidin synthetase subunit D  31.42 
 
 
3374 aa  217  5e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33280  peptide synthase  33.26 
 
 
4342 aa  217  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.46218 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6556  siderophore 2,3-dihydroxybenzoate (DHB) synthesis protein  37.86 
 
 
1305 aa  216  8e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.416947  hitchhiker  0.00000457979 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2364  peptide synthetase, putative  36.86 
 
 
3650 aa  216  8e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1676  amino acid adenylation domain-containing protein  36.75 
 
 
3432 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.602072 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4753  amino acid adenylation domain-containing protein  37.35 
 
 
6176 aa  216  9.999999999999999e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.86552 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2869  amino acid adenylation domain-containing protein  36.32 
 
 
5328 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.127211 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2569  amino acid adenylation domain-containing protein  31.4 
 
 
2971 aa  214  4.9999999999999996e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00188555 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2418  peptide synthetase-like protein  36.55 
 
 
3296 aa  213  7e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.11449  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3562  peptide synthase  32.58 
 
 
4317 aa  213  7e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1867  non-ribosomal peptide synthase:amino acid adenylation  36.41 
 
 
3629 aa  210  5e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0982  amino acid adenylation domain protein  28.15 
 
 
2006 aa  206  7e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3730  amino acid adenylation domain-containing protein  34.18 
 
 
2651 aa  206  7e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.390082 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1160  amino acid adenylation  37.12 
 
 
3231 aa  206  1e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1640  amino acid adenylation domain-containing protein  37.12 
 
 
3231 aa  206  1e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1883  non-ribosomal peptide synthetase  32.73 
 
 
1314 aa  205  3e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.20791  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1958  non-ribosomal peptide synthase:amino acid adenylation  34.11 
 
 
2666 aa  204  3e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.815513 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1945  peptide synthase  32.71 
 
 
4336 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5064  amino acid adenylation domain protein  33.21 
 
 
4449 aa  201  1.9999999999999998e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1624  peptide synthase  33.11 
 
 
4317 aa  201  3e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3940  peptide synthase  31.85 
 
 
4332 aa  201  3e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.862701 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3809  peptide synthase  32.81 
 
 
4317 aa  201  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1598  amino acid adenylation domain-containing protein  36.11 
 
 
3219 aa  200  6e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00546873 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4243  peptide synthase  33.04 
 
 
4317 aa  200  7e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>