25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2345 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2345  flagellar assembly protein FliH  100 
 
 		 226 aa  432  1e-120  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.126555  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0843  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like  36.73 
 
 		 243 aa  79.7  0.00000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0976  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  36.32 
 
 		 220 aa  71.6  0.000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1652  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like  33.33 
 
 		 259 aa  60.5  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0257969  normal  0.368301 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3064  flagellar assembly protein FliH  31.3 
 
 		 334 aa  53.9  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1967  flagellar assembly protein FliH  36.26 
 
 		 242 aa  52.8  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.147072  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0552  flagellar assembly protein FliH  30.94 
 
 		 227 aa  52.8  0.000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5099  flagellar assembly protein H  35.45 
 
 		 255 aa  52.4  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.484808  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1620  flagellar assembly protein FliH  28.86 
 
 		 324 aa  52.4  0.000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0757  hypothetical protein  36.07 
 
 		 224 aa  52  0.000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1538  flagellar assembly protein H  29.38 
 
 		 268 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1995  flagellar assembly protein FliH  29.89 
 
 		 296 aa  46.6  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5263  flagellar assembly protein H  30.81 
 
 		 278 aa  47  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.16543  normal  0.0759214 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2357  flagellar assembly protein FliH  28.49 
 
 		 243 aa  47  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0496  flagellar assembly protein FliH  39.68 
 
 		 307 aa  45.4  0.0007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3692  flagellar assembly protein H  27.47 
 
 		 254 aa  44.3  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.438422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1351  flagellar assembly protein H  27.57 
 
 		 316 aa  44.3  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.143361  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3928  flagellar assembly protein H  28.02 
 
 		 260 aa  43.1  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3079  flagellar assembly protein FliH  30.65 
 
 		 244 aa  43.1  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.131312  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4367  flagellar assembly protein H  28.02 
 
 		 263 aa  43.1  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.631289 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3805  flagellar assembly protein FliH  30.65 
 
 		 244 aa  43.1  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0570665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1500  flagellar assembly protein H  28.02 
 
 		 264 aa  43.1  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.309045 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1284  flagellar assembly protein H  27.03 
 
 		 316 aa  42.7  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3302  flagellar assembly protein FliH  38.24 
 
 		 257 aa  42  0.007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1368  flagellar assembly protein FliH  29.15 
 
 		 339 aa  41.6  0.009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.981358 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>