17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1531 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1531  hypothetical protein  100 
 
 		 254 aa  497  1e-140  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.460343  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4520  hypothetical protein  60.16 
 
 		 259 aa  246  3e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00166177  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6402  hypothetical protein  39.2 
 
 		 268 aa  145  5e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.577893  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6866  hypothetical protein  38.55 
 
 		 272 aa  144  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.592244  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6899  hypothetical protein  36.8 
 
 		 258 aa  131  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38140  hypothetical protein  34.8 
 
 		 259 aa  106  4e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35670  hypothetical protein  32.72 
 
 		 263 aa  103  3e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.222488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6218  hypothetical protein  30.3 
 
 		 256 aa  86.3  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35660  hypothetical protein  31 
 
 		 275 aa  85.9  5e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.335426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24990  hypothetical protein  31.17 
 
 		 254 aa  79.3  0.00000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01430  hypothetical protein  27.76 
 
 		 261 aa  76.6  0.0000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0268047 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6816  hypothetical protein  30.12 
 
 		 266 aa  71.6  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.701031  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2190  hypothetical protein  28.24 
 
 		 264 aa  65.9  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0151  hypothetical protein  28.46 
 
 		 252 aa  57.4  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01870  hypothetical protein  26.88 
 
 		 262 aa  52.4  0.000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3645  hypothetical protein  29.26 
 
 		 275 aa  43.9  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6898  hypothetical protein  38.33 
 
 		 176 aa  42  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>