More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0783 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_0783  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  100 
 
 
347 aa  691    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.604967  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1404  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  73.2 
 
 
348 aa  496  1e-139  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.306134 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4431  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  66.77 
 
 
352 aa  441  9.999999999999999e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.761355  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0381  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  57.6 
 
 
343 aa  390  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.386855  normal  0.701371 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1861  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.88 
 
 
345 aa  211  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2359  alcohol dehydrogenase  38.04 
 
 
351 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.137767 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3064  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.2 
 
 
367 aa  195  1e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2960  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.8 
 
 
367 aa  186  6e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2630  alcohol dehydrogenase  35.82 
 
 
339 aa  168  1e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.380756  normal  0.317622 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2827  alcohol dehydrogenase  36.12 
 
 
339 aa  166  5.9999999999999996e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.582411  normal  0.0605973 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0848  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.93 
 
 
343 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6197  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.93 
 
 
343 aa  162  6e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.892038  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2218  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.58 
 
 
343 aa  153  4e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2398  zinc-binding alcohol dehydrogenase  31.56 
 
 
335 aa  147  3e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.860037  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2147  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  30.23 
 
 
328 aa  136  4e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1807  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.82 
 
 
324 aa  137  4e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1944  quinone oxidoreductase  30.23 
 
 
328 aa  136  5e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0819038  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11941  oxidoreductase fadB5  34.69 
 
 
334 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1920  quinone oxidoreductase  30.36 
 
 
328 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30440  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  33.73 
 
 
307 aa  135  1.9999999999999998e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.051943  normal  0.176939 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2529  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.31 
 
 
322 aa  134  1.9999999999999998e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3191  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  29.85 
 
 
328 aa  134  3e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0472649  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2194  alcohol dehydrogenase  33.84 
 
 
329 aa  131  1.0000000000000001e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.482564  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2563  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.33 
 
 
311 aa  130  3e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.111047  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0930  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.31 
 
 
324 aa  130  3e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2776  putative alcohol dehydrogenase  34.15 
 
 
319 aa  130  3e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1965  quinone oxidoreductase  30.58 
 
 
328 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2113  quinone oxidoreductase  30.58 
 
 
328 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2194  quinone oxidoreductase  29.55 
 
 
328 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0247156  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2265  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  30.03 
 
 
328 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.846418  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23320  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  33.13 
 
 
322 aa  127  2.0000000000000002e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.115564  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5977  putative oxidoreductase  29.65 
 
 
325 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1496  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.23 
 
 
321 aa  127  4.0000000000000003e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000022092 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1910  zinc-binding alcohol dehydrogenase  30.57 
 
 
324 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3581  response regulator receiver protein  31.47 
 
 
332 aa  126  5e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.84389 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3497  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.24 
 
 
345 aa  126  5e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.157273  normal  0.487323 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5249  quinone oxidoreductase  36.25 
 
 
327 aa  126  6e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.520228 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3438  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.62 
 
 
321 aa  126  6e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.661509  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0419  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  32.23 
 
 
320 aa  126  6e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0538396  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1957  alcohol dehydrogenase  28.96 
 
 
328 aa  126  7e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0178184  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0553  alcohol dehydrogenase  32.7 
 
 
325 aa  126  7e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0307226  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2114  alcohol dehydrogenase  32.22 
 
 
322 aa  125  9e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.76358  decreased coverage  0.00286846 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3534  alcohol dehydrogenase  32.83 
 
 
323 aa  125  9e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.311979  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5033  alcohol dehydrogenase  29.47 
 
 
325 aa  125  9e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2228  putative quinone oxidoreductase  33.02 
 
 
322 aa  125  1e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.806393  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1489  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  38.89 
 
 
330 aa  124  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.151992  normal  0.194221 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69110  putative oxidoreductase  29.97 
 
 
325 aa  125  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5231  oxidoreductase, zinc-binding protein  28.84 
 
 
325 aa  124  3e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0313  alcohol dehydrogenase  30.28 
 
 
326 aa  124  3e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2123  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  29.08 
 
 
328 aa  123  5e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2619  zinc-binding alcohol dehydrogenase  30.4 
 
 
324 aa  122  7e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.869285  normal  0.466568 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3633  alcohol dehydrogenase  29.52 
 
 
325 aa  122  9.999999999999999e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4130  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.04 
 
 
313 aa  122  9.999999999999999e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0313  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  27.99 
 
 
328 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.196168 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1644  alcohol dehydrogenase  30.58 
 
 
325 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.44369 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2810  alcohol dehydrogenase  29.02 
 
 
325 aa  121  1.9999999999999998e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48867  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1952  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  30.29 
 
 
332 aa  120  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0615  putative oxidoreductase  31.13 
 
 
305 aa  120  3e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5271  alcohol dehydrogenase  30.5 
 
 
325 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1191  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.01 
 
 
323 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.87291  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3228  alcohol dehydrogenase  30.7 
 
 
324 aa  119  6e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.603844 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4322  alcohol dehydrogenase  31.91 
 
 
324 aa  119  6e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0281  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.83 
 
 
320 aa  119  6e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3201  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  32.12 
 
 
324 aa  119  6e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0753  zinc-binding alcohol dehydrogenase  30.82 
 
 
329 aa  119  6e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5710  alcohol dehydrogenase  33.13 
 
 
324 aa  119  6e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1694  zinc-binding alcohol dehydrogenase  31.33 
 
 
325 aa  119  7.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0377622  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0571  quinone oxidoreductase  30.06 
 
 
324 aa  119  9.999999999999999e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0112  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.25 
 
 
334 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.985575  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1621  quinone oxidoreductase putative PIG3  30.7 
 
 
336 aa  118  9.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.463823  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1056  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  30.77 
 
 
334 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.691912  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4346  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.75 
 
 
306 aa  118  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0220735  normal  0.953349 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4263  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  30.72 
 
 
342 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.493971  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7384  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.34 
 
 
325 aa  118  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1582  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.12 
 
 
324 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.45945  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1096  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.93 
 
 
317 aa  118  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.874721  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14430  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  36.98 
 
 
333 aa  118  1.9999999999999998e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.587112  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3068  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.18 
 
 
326 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0181294  normal  0.830882 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2527  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  33.13 
 
 
323 aa  117  1.9999999999999998e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.450235  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0261  NAD(P)H quinone oxidoreductase PIG3 family  29.1 
 
 
324 aa  118  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5119  alcohol dehydrogenase  30.5 
 
 
325 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1494  alcohol dehydrogenase  31.71 
 
 
321 aa  117  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.275992  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1942  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.27 
 
 
323 aa  117  1.9999999999999998e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5040  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.44 
 
 
323 aa  117  3e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.13939  normal  0.514395 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5121  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.61 
 
 
324 aa  117  3e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3133  alcohol dehydrogenase  29.62 
 
 
307 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0740  alcohol dehydrogenase  34.04 
 
 
320 aa  117  3e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.869283 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7387  putative quinone oxidoreductase  30.15 
 
 
319 aa  117  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2472  alcohol dehydrogenase  31.73 
 
 
325 aa  117  3.9999999999999997e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.439289  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2044  zinc-binding alcohol dehydrogenase  30.4 
 
 
324 aa  116  5e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5210  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  30.19 
 
 
325 aa  116  6e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5659  alcohol dehydrogenase  32.62 
 
 
329 aa  116  6e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.591767 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2092  quinone oxidoreductase putative PIG3  30.09 
 
 
332 aa  116  6e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.187867  hitchhiker  0.000106437 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3723  zinc-binding alcohol dehydrogenase  32.62 
 
 
329 aa  116  6e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.250647  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4645  alcohol dehydrogenase  32.62 
 
 
329 aa  116  6e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1504  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  28.88 
 
 
324 aa  116  6.9999999999999995e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0905187 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6496  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.65 
 
 
305 aa  116  6.9999999999999995e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0196  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  31.8 
 
 
322 aa  115  6.9999999999999995e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2572  alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  31.25 
 
 
319 aa  116  6.9999999999999995e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0649604  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2376  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.02 
 
 
322 aa  116  6.9999999999999995e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.487886  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>