50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0673 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0673  protein of unknown function DUF501  100 
 
 		 165 aa  337  5e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32230  hypothetical protein  76.43 
 
 		 168 aa  230  7.000000000000001e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11043  hypothetical protein  72.79 
 
 		 163 aa  220  7e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4769  hypothetical protein  72.3 
 
 		 163 aa  217  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1956  hypothetical protein  72.11 
 
 		 164 aa  216  7.999999999999999e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0133453  normal  0.340354 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4324  hypothetical protein  67.7 
 
 		 166 aa  214  5e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.956577  normal  0.562122 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4617  hypothetical protein  67.7 
 
 		 166 aa  214  5e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.478193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4238  hypothetical protein  67.7 
 
 		 166 aa  214  5e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.701665  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0154  protein of unknown function DUF501  63.23 
 
 		 187 aa  201  3e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0892  hypothetical protein  64.52 
 
 		 185 aa  200  8e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.1319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0835  hypothetical protein  62.58 
 
 		 185 aa  197  6e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.311533 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1572  protein of unknown function DUF501  69.33 
 
 		 171 aa  194  3e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1921  protein of unknown function DUF501  62.89 
 
 		 183 aa  194  4.0000000000000005e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07060  hypothetical protein  62.35 
 
 		 179 aa  194  5.000000000000001e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3921  hypothetical protein  64.97 
 
 		 210 aa  193  1e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0720099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07870  hypothetical protein  62.11 
 
 		 173 aa  193  1e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.288834 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0922  protein of unknown function DUF501  63.87 
 
 		 193 aa  188  4e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.141888  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0809  hypothetical protein  65.52 
 
 		 178 aa  186  9e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.194337 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0911  protein of unknown function DUF501  57.59 
 
 		 187 aa  186  1e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1907  hypothetical protein  61.84 
 
 		 209 aa  184  3e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.939613 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5821  hypothetical protein  54.94 
 
 		 168 aa  184  7e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0073  protein of unknown function DUF501  59.88 
 
 		 195 aa  181  4.0000000000000006e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.223965  normal  0.218022 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3130  hypothetical protein  58.54 
 
 		 171 aa  181  5.0000000000000004e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0372081  normal  0.0207844 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0930  hypothetical protein  55.56 
 
 		 168 aa  180  7e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3163  protein of unknown function DUF501  61.22 
 
 		 176 aa  179  1e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1020  protein of unknown function DUF501  58.39 
 
 		 211 aa  179  1e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0462853 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0430  hypothetical protein  58.28 
 
 		 188 aa  179  2e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.70163  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8579  hypothetical protein  55.56 
 
 		 213 aa  175  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.455721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1222  protein of unknown function DUF501  56.88 
 
 		 223 aa  172  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000463664 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2680  protein of unknown function DUF501  57.32 
 
 		 173 aa  170  1e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1149  hypothetical protein  54.37 
 
 		 233 aa  165  2.9999999999999998e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.220769  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1038  protein of unknown function DUF501  57.24 
 
 		 182 aa  165  2.9999999999999998e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05000  exopolyphosphatase  55.76 
 
 		 532 aa  156  1e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.442897  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1075  protein of unknown function DUF501  56.71 
 
 		 182 aa  155  2e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.786986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13470  hypothetical protein  53.9 
 
 		 189 aa  150  8e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0490421  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0667  Ppx/GppA phosphatase family protein  49.06 
 
 		 568 aa  144  5e-34  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0773  hypothetical protein  47.83 
 
 		 188 aa  136  1e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.818853  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1666  hypothetical protein  40.91 
 
 		 170 aa  111  5e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1656  hypothetical protein  37.27 
 
 		 170 aa  107  1e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1739  hypothetical protein  38.06 
 
 		 170 aa  106  1e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0186  hypothetical protein  35.9 
 
 		 175 aa  102  2e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3040  hypothetical protein  37.04 
 
 		 173 aa  102  2e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.503627  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1853  hypothetical protein  36.54 
 
 		 177 aa  99.4  2e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.922543  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3951  hypothetical protein  32.32 
 
 		 171 aa  94.7  5e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.757382  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00530  hypothetical protein  33.54 
 
 		 179 aa  89.7  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000246936  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0915  hypothetical protein  36.08 
 
 		 145 aa  70.5  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000324593  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_35406  predicted protein  25 
 
 		 294 aa  65.5  0.0000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.528252  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35692  predicted protein  35.34 
 
 		 326 aa  63.5  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.933776  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1562  protein of unknown function DUF501  33.09 
 
 		 152 aa  51.6  0.000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1300  protein of unknown function DUF501  29.46 
 
 		 196 aa  45.8  0.0003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000439461  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>