28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1054 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1054  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 323 aa  646    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.910454  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1071  Radical SAM domain protein  42.52 
 
 		 332 aa  244  9.999999999999999e-64  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000639337  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0641  Radical SAM domain protein  38.59 
 
 		 392 aa  223  3e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.071148 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2207  radical SAM domain protein  38.24 
 
 		 407 aa  222  9e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.173397  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0446  radical SAM family protein  40.82 
 
 		 325 aa  213  2.9999999999999995e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2546  radical SAM domain protein  40.07 
 
 		 377 aa  206  5e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2174  Radical SAM domain protein  40.07 
 
 		 373 aa  206  5e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000664459 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2087  Radical SAM domain protein  33.89 
 
 		 301 aa  180  2e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1559  radical SAM domain-containing protein  35.62 
 
 		 299 aa  179  7e-44  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0415302 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0647  Radical SAM domain protein  33.33 
 
 		 279 aa  159  7e-38  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1519  Elongator protein 3/MiaB/NifB  30.37 
 
 		 267 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0920  radical SAM domain-containing protein  30 
 
 		 249 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0171174  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0942  radical SAM domain-containing protein  29.58 
 
 		 249 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1948  radical SAM domain-containing protein  27.94 
 
 		 288 aa  115  6.9999999999999995e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1142  biotin synthetase-like protein  27.35 
 
 		 253 aa  101  1e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.918331  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1700  radical SAM domain-containing protein  27.43 
 
 		 252 aa  97.8  2e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1507  radical SAM domain-containing protein  27.66 
 
 		 280 aa  92.4  9e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_46799  predicted protein  23.89 
 
 		 311 aa  48.1  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.970391 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1410  biotin synthase  23.61 
 
 		 375 aa  46.6  0.0006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000875332  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2092  thiamine biosynthesis protein ThiH  24.84 
 
 		 371 aa  46.2  0.0007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.62908 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0671  Radical SAM domain protein  23.23 
 
 		 468 aa  46.2  0.0008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1908  Biotin synthase  27.92 
 
 		 370 aa  46.2  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1886  thiamine biosynthesis protein ThiH  24.51 
 
 		 371 aa  45.4  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06643  biotin synthase (Eurofung)  22.84 
 
 		 393 aa  45.1  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2655  biotin synthase  28.18 
 
 		 324 aa  45.1  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.797628  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2068  Radical SAM domain protein  34.59 
 
 		 399 aa  45.1  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.184452  hitchhiker  0.00128487 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1941  thiamine biosynthesis protein ThiH  23.86 
 
 		 371 aa  43.1  0.007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0506  biotin synthase  28.95 
 
 		 364 aa  42.7  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>