42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1559 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_1559  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 299 aa  611  9.999999999999999e-175  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0415302 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2087  Radical SAM domain protein  63.3 
 
 		 301 aa  402  1e-111  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2207  radical SAM domain protein  31.8 
 
 		 407 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.173397  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1071  Radical SAM domain protein  34.22 
 
 		 332 aa  184  2.0000000000000003e-45  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000639337  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1054  Radical SAM domain protein  35.62 
 
 		 323 aa  179  5.999999999999999e-44  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.910454  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0641  Radical SAM domain protein  30.23 
 
 		 392 aa  169  4e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.071148 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2174  Radical SAM domain protein  33.9 
 
 		 373 aa  166  2.9999999999999998e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000664459 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2546  radical SAM domain protein  33.9 
 
 		 377 aa  167  2.9999999999999998e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0446  radical SAM family protein  33.68 
 
 		 325 aa  150  3e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0647  Radical SAM domain protein  29.55 
 
 		 279 aa  120  1.9999999999999998e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1948  radical SAM domain-containing protein  29.15 
 
 		 288 aa  102  6e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1519  Elongator protein 3/MiaB/NifB  24.8 
 
 		 267 aa  92.4  8e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0920  radical SAM domain-containing protein  29.73 
 
 		 249 aa  91.3  2e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0171174  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0942  radical SAM domain-containing protein  29.28 
 
 		 249 aa  90.1  4e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1507  radical SAM domain-containing protein  26.61 
 
 		 280 aa  75.5  0.000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1700  radical SAM domain-containing protein  26.13 
 
 		 252 aa  68.9  0.00000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1142  biotin synthetase-like protein  28.19 
 
 		 253 aa  68.2  0.0000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.918331  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1128  Radical SAM domain protein  28.4 
 
 		 327 aa  56.2  0.0000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.823251 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2103  biotin synthase  26.05 
 
 		 353 aa  54.7  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.881041  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02190  biotin synthase  24.02 
 
 		 412 aa  49.7  0.00005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2901  Radical SAM domain protein  22.67 
 
 		 359 aa  48.9  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.297507 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1793  metallo cofactor biosynthesis protein  22.34 
 
 		 399 aa  46.6  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0512  radical SAM domain-containing protein  25.66 
 
 		 347 aa  46.6  0.0005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000575478  hitchhiker  0.000767983 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  23.6 
 
 		 399 aa  46.6  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2393  Radical SAM domain protein  23.29 
 
 		 399 aa  45.8  0.0009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_46799  predicted protein  24.55 
 
 		 311 aa  45.8  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.970391 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2541  biotin synthase  25.2 
 
 		 337 aa  45.4  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00179392  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2614  Radical SAM domain protein  23.84 
 
 		 316 aa  44.7  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0838  biotin synthase  21.49 
 
 		 350 aa  43.9  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0020  biotin synthase  27.54 
 
 		 320 aa  44.3  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000521068  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2068  Radical SAM domain protein  26.14 
 
 		 399 aa  43.9  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.184452  hitchhiker  0.00128487 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2710  radical SAM family Fe-S protein  21.97 
 
 		 413 aa  44.3  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19160  biotin synthase  23.5 
 
 		 350 aa  43.5  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0257647  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0570  RNA modification enzyme, MiaB family  21.92 
 
 		 447 aa  43.5  0.004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0912  Radical SAM domain protein  27.66 
 
 		 368 aa  43.5  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.492815  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0691  radical SAM domain-containing protein  23.65 
 
 		 333 aa  43.5  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0876  radical SAM domain-containing protein  23.57 
 
 		 398 aa  43.1  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0451643  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0826  biotin synthase  22.6 
 
 		 341 aa  42.7  0.007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.247996  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0919  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, Fe-S oxidoreductase  29.86 
 
 		 292 aa  42.7  0.008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1100  radical SAM domain-containing protein  18.5 
 
 		 470 aa  42.4  0.009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2458  Biotin synthase  19.48 
 
 		 339 aa  42.4  0.009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0266  biotin synthase protein  22.04 
 
 		 360 aa  42.4  0.01  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>