22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1507 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_1507  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 280 aa  575  1.0000000000000001e-163  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0647  Radical SAM domain protein  29.03 
 
 		 279 aa  103  2e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1948  radical SAM domain-containing protein  26.79 
 
 		 288 aa  102  6e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1054  Radical SAM domain protein  27.66 
 
 		 323 aa  92.4  7e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.910454  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0446  radical SAM family protein  29.56 
 
 		 325 aa  92.4  7e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1519  Elongator protein 3/MiaB/NifB  24.44 
 
 		 267 aa  89  7e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1071  Radical SAM domain protein  28.21 
 
 		 332 aa  87.4  2e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000639337  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0942  radical SAM domain-containing protein  28.77 
 
 		 249 aa  86.3  5e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0920  radical SAM domain-containing protein  28.77 
 
 		 249 aa  85.9  8e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0171174  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0641  Radical SAM domain protein  25.18 
 
 		 392 aa  80.9  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.071148 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2207  radical SAM domain protein  24.91 
 
 		 407 aa  76.6  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.173397  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1559  radical SAM domain-containing protein  26.61 
 
 		 299 aa  75.5  0.000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0415302 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1700  radical SAM domain-containing protein  26.2 
 
 		 252 aa  74.3  0.000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1142  biotin synthetase-like protein  26.24 
 
 		 253 aa  71.2  0.00000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.918331  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2174  Radical SAM domain protein  25.27 
 
 		 373 aa  70.5  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000664459 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2546  radical SAM domain protein  25.27 
 
 		 377 aa  70.1  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2087  Radical SAM domain protein  23.98 
 
 		 301 aa  60.5  0.00000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1495  tRNA-i(6)A37 thiotransferase enzyme MiaB  24.61 
 
 		 451 aa  47.4  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.421573  hitchhiker  0.000974888 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0078  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  24.41 
 
 		 435 aa  45.4  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.68199  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0756  MiaB-like tRNA modifying enzyme  24.11 
 
 		 404 aa  43.9  0.003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1699  RNA modification enzyme, MiaB family  23.68 
 
 		 478 aa  42.7  0.007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000319842  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1607  biotin synthase  25.81 
 
 		 337 aa  42.4  0.009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.18444  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>