More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0736 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_0736  putative dTDP-rhamnosyl transferase  100 
 
 
281 aa  541  1e-153  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.574558  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0736  glycosyl transferase family protein  40.32 
 
 
326 aa  149  4e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.59773 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5877  glycosyl transferase family protein  38.19 
 
 
303 aa  147  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.191547  normal  0.690247 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1728  glycosyl transferase family protein  39.74 
 
 
291 aa  145  9e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.711206  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2344  glycosyl transferase family 2  41.91 
 
 
301 aa  144  1e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.415521  hitchhiker  0.0000247035 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4181  glycosyl transferase family 2  39.34 
 
 
297 aa  142  4e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.208224  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06160  predicted glycosyltransferase  43.79 
 
 
288 aa  136  4e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0796439  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1854  glycosyl transferase family 2  35.69 
 
 
307 aa  135  8e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13294  dTDP-RHA:A-D-GlcNAc-diphosphoryl polyprenol-A-3-L-rhamnosyl transferase wbbL1  36.54 
 
 
301 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.621621 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6339  glycosyl transferase family 2  40.64 
 
 
285 aa  133  3e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1356  glycosyl transferase family protein  36.21 
 
 
296 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00877043  normal  0.475844 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1320  glycosyl transferase family protein  36.21 
 
 
296 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1337  glycosyl transferase family protein  36.21 
 
 
296 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.945092 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1063  glycosyl transferase family 2  33.11 
 
 
305 aa  130  2.0000000000000002e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.862808  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4735  glycosyl transferase family protein  35.04 
 
 
291 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.27688  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4318  glycosyl transferase family 2  38.21 
 
 
310 aa  124  1e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.592459  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0817  hypothetical protein  24.55 
 
 
297 aa  107  3e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3093  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.57 
 
 
276 aa  106  4e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3153  putative glycosyl transferase WbiF  36.57 
 
 
318 aa  106  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3130  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.57 
 
 
276 aa  106  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0842  hypothetical protein  24.73 
 
 
297 aa  105  1e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0840  hypothetical protein  26.03 
 
 
296 aa  104  2e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2764  putative glycosyl transferase  36.11 
 
 
266 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.266345  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1841  putative glycosyl transferase  36.11 
 
 
266 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.718732  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1979  glycosyl transferase, putative  36.11 
 
 
276 aa  103  3e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1348  glycosyl transferase family protein  32.38 
 
 
311 aa  103  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0934  putative glycosyl transferase  36.11 
 
 
318 aa  103  3e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.164411  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1593  glycosyl transferase family protein  34.44 
 
 
317 aa  102  6e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1825  glycosyl transferase family protein  30.92 
 
 
324 aa  101  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4265  glycosyl transferase family protein  31.03 
 
 
312 aa  100  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0899  glycosyl transferase family 2  35.89 
 
 
281 aa  99  9e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2720  glycosyl transferase family protein  32.41 
 
 
318 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.372811  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1273  glycosyl transferase family protein  33.63 
 
 
307 aa  96.7  4e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2507  glycosyl transferase family protein  35.84 
 
 
221 aa  96.7  4e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3135  glycosyl transferase, putative  32.09 
 
 
318 aa  96.3  5e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.331017  normal  0.385632 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2910  glycosyl transferase family protein  32.09 
 
 
318 aa  95.5  8e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2579  glycosyl transferase family protein  32.09 
 
 
318 aa  95.5  8e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1840  glycosyl transferase family 2  29.61 
 
 
324 aa  93.6  3e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.939946  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0375  glycosyl transferase family protein  37.05 
 
 
311 aa  93.6  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0457  glycosyl transferase family protein  34.22 
 
 
247 aa  92.4  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1013  glycosyl transferase family 2  29.28 
 
 
334 aa  92.4  7e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00302426  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2168  glycosyl transferase family protein  29.08 
 
 
360 aa  92  9e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1480  glycosyl transferase, group 2 family protein, putative  32.8 
 
 
276 aa  90.9  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4607  glycosyl transferase family protein  36.16 
 
 
306 aa  90.9  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.71448  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3783  putative glycosyl transferase  35.8 
 
 
281 aa  90.9  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.193326  normal  0.301311 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0801  glycosyl transferase family 2  29.09 
 
 
313 aa  90.5  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0377  glycosyl transferase family protein  32.11 
 
 
314 aa  89.7  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.359383  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1044  b-glycosyltransferase  25.52 
 
 
652 aa  89.7  5e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00623044  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3119  glycosyl transferase family protein  33.03 
 
 
282 aa  89  9e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1007  glycosyl transferase family protein  28.74 
 
 
336 aa  88.2  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.47724 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3981  glycosyl transferase family protein  34.29 
 
 
284 aa  88.6  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.653687 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4474  glycosyl transferase family 2  23.84 
 
 
290 aa  87.4  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3990  glycosyl transferase family protein  30.83 
 
 
304 aa  88.2  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.965976 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1368  glycosyl transferase family protein  29.06 
 
 
324 aa  87  3e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.537191  normal  0.711331 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3264  glycosyl transferase family 2  31.75 
 
 
248 aa  87  3e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5292  glycosyl transferase family 2  30.4 
 
 
327 aa  86.7  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2407  glycosyl transferase family protein  30.2 
 
 
312 aa  86.7  4e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.116461  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4940  glycosyl transferase family protein  31.96 
 
 
336 aa  85.9  6e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.860283 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2412  glycosyl transferase family 2  28.04 
 
 
274 aa  85.9  6e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000311444  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1579  glycosyl transferase family protein  35.29 
 
 
318 aa  85.9  7e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.35814 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4256  glycosyl transferase family protein  31.47 
 
 
336 aa  85.5  8e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.586342  normal  0.139884 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3344  glycosyl transferase family protein  32.3 
 
 
274 aa  85.5  9e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.27907 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2722  glycosyl transferase family protein  31.76 
 
 
278 aa  85.5  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1435  glycosyl transferase family protein  31.63 
 
 
324 aa  84  0.000000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4605  glycosyl transferase family protein  30.97 
 
 
318 aa  83.2  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.151832  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6543  glycosyl transferase family protein  32.07 
 
 
329 aa  82.8  0.000000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.118819 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1912  glycosyl transferase family protein  31.19 
 
 
329 aa  82.8  0.000000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0693  glycosyl transferase family 2  26.57 
 
 
277 aa  82.4  0.000000000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1576  glycosyl transferase family protein  33.03 
 
 
313 aa  82.4  0.000000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.169867 
 
 
-
 
NC_002950  PG0264  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.39 
 
 
355 aa  81.6  0.00000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2292  glycosyl transferase family protein  32.95 
 
 
281 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.863686  normal  0.600006 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0463  glycosyl transferase family protein  30.04 
 
 
293 aa  82  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.580187 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2729  glycosyl transferase family protein  30.09 
 
 
298 aa  82  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4741  glycosyl transferase family protein  28.85 
 
 
308 aa  82  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5349  glycosyl transferase family protein  32.9 
 
 
314 aa  80.9  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3706  glycosyl transferase family 2  32.29 
 
 
325 aa  81.3  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000558134  hitchhiker  0.00000472149 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0854  glycosyl transferase family protein  34.68 
 
 
281 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0831  glycosyl transferase family protein  34.39 
 
 
691 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.74925  normal  0.236177 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0503  glycosyl transferase family protein  32.75 
 
 
290 aa  80.5  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0779995  normal  0.962073 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0754  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
691 aa  80.5  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.235056 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0791  glycosyl transferase family 2  33.94 
 
 
691 aa  80.1  0.00000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.62869  normal  0.0614605 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3908  glycosyl transferase, WecB/TagA/CpsF family  28.09 
 
 
907 aa  79.7  0.00000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2676  b-glycosyltransferase  26.92 
 
 
338 aa  79.3  0.00000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1795  glycosyl transferase family protein  28.9 
 
 
306 aa  79  0.00000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0405  glycosyl transferase family protein  34.1 
 
 
268 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4524  glycosyl transferase family protein  26.95 
 
 
308 aa  78.2  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.500037  normal  0.110607 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0628  glycosyl transferase family protein  27.97 
 
 
306 aa  78.2  0.0000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.154474 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0884  glycosyl transferase family protein  34.1 
 
 
281 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1388  glycosyl transferase family protein  30.43 
 
 
324 aa  78.2  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3719  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 
327 aa  77.8  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2875  glycosyl transferase family 2  35.11 
 
 
324 aa  77.8  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0409  glycosyl transferase family 2  26.02 
 
 
315 aa  77.8  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.535242  hitchhiker  0.0010651 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0233  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.02 
 
 
315 aa  77.8  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.885705  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3226  glycosyl transferase family protein  29.79 
 
 
317 aa  77.8  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2967  glycosyl transferase family 2  33.85 
 
 
324 aa  77.8  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1249  glycosyl transferase  30.91 
 
 
275 aa  77  0.0000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1219  glycosyl transferase family protein  30.91 
 
 
275 aa  76.6  0.0000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.428258  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4051  WecB/TagA/CpsF family glycosyl transferase  32 
 
 
884 aa  76.6  0.0000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2683  glycosyl transferase family 2  25.18 
 
 
361 aa  76.6  0.0000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.624324  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0684  glycosyl transferase family 2  26.4 
 
 
350 aa  75.9  0.0000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.584656 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>