15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0676 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0676  PilT protein domain protein  100 
 
 		 146 aa  279  1e-74  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10560  hypothetical protein  52.38 
 
 		 137 aa  114  3e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.020185 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3484  PilT protein domain protein  40.34 
 
 		 130 aa  64.7  0.0000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11735  hypothetical protein  35.4 
 
 		 129 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3700  PilT protein domain protein  38.02 
 
 		 130 aa  49.7  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10978  hypothetical protein  37.63 
 
 		 127 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00025146  normal  0.536997 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3163  PilT protein domain protein  38.52 
 
 		 138 aa  47.8  0.00006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5200  PilT domain-containing protein  38.76 
 
 		 155 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3774  PilT domain-containing protein  30.95 
 
 		 138 aa  44.3  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3094  PilT protein domain protein  31.4 
 
 		 137 aa  44.7  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.492966 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10065  hypothetical protein  35.87 
 
 		 133 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.814424 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1502  PilT protein-like  32.5 
 
 		 133 aa  43.5  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2191  PilT domain-containing protein  36.29 
 
 		 141 aa  43.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.556042  normal  0.493855 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1758  PilT protein  32.77 
 
 		 131 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.139479 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1738  PilT protein domain protein  29.91 
 
 		 130 aa  42.4  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000240428  normal  0.135442 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>