23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_0064 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007760  Adeh_0064  rhomboid-like protein  100 
 
 		 246 aa  474  1e-133  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0646008  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0082  Rhomboid family protein  97.97 
 
 		 246 aa  421  1e-117  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0070  Rhomboid family protein  97.97 
 
 		 246 aa  398  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.645934  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0066  rhomboid family protein  50 
 
 		 244 aa  222  4e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.167584  normal  0.0382417 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1913  hypothetical protein  27.34 
 
 		 265 aa  54.3  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000312193  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2277  Rhomboid family protein  22.29 
 
 		 283 aa  52  0.000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0617  hypothetical protein  30 
 
 		 273 aa  50.4  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08350  hypothetical protein  25.11 
 
 		 265 aa  49.3  0.00006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1426  hypothetical protein  28.11 
 
 		 276 aa  48.9  0.00006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0139  hypothetical protein  28.85 
 
 		 243 aa  48.9  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05680  peptidase, S54 (rhomboid) family, putative  29.66 
 
 		 232 aa  48.1  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.811656  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1609  rhomboid family protein  25.34 
 
 		 220 aa  48.1  0.0001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2536  Rhomboid family protein  22.63 
 
 		 273 aa  47.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.237379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0665  rhomboid family protein  30 
 
 		 200 aa  47.4  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2879  Rhomboid family protein  29.25 
 
 		 224 aa  47.8  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1663  integral membrane protein  24.66 
 
 		 220 aa  47  0.0003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.771185  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2735  rhomboid family protein  22.03 
 
 		 278 aa  46.6  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.77359  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2901  hypothetical protein  23.08 
 
 		 297 aa  46.6  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000120399  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1220  Rhomboid family protein  24.37 
 
 		 228 aa  46.2  0.0005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.231981 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4665  rhomboid-like protein  23.08 
 
 		 285 aa  45.8  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.545556 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0124  rhomboid family protein  28 
 
 		 209 aa  45.4  0.0009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1588  Rhomboid family protein  27.13 
 
 		 296 aa  44.7  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.186801  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1860  Rhomboid family protein  28.57 
 
 		 519 aa  42.7  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000892671  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>