26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0524 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_0524  hypothetical protein  100 
 
 
196 aa  375  1e-103  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0935  hypothetical protein  41.13 
 
 
192 aa  73.9  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.879201  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1053  hypothetical protein  41.13 
 
 
192 aa  73.9  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.308187 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2496  hypothetical protein  33.33 
 
 
188 aa  52.4  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000377569  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1042  hypothetical protein  34.38 
 
 
288 aa  50.1  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0835293  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0131  hypothetical protein  45.9 
 
 
213 aa  48.5  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3620  hypothetical protein  34.88 
 
 
184 aa  48.1  0.00009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.794068  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1752  hypothetical protein  36.56 
 
 
173 aa  47.4  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000963449  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2054  hypothetical protein  47.83 
 
 
329 aa  46.2  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1260  hypothetical protein  31.96 
 
 
267 aa  46.6  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.541563  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0766  hypothetical protein  37.29 
 
 
255 aa  46.6  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00180926  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1284  hypothetical protein  35.09 
 
 
128 aa  46.6  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000190603  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1978  hypothetical protein  36.49 
 
 
165 aa  45.8  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0232  hypothetical protein  41.67 
 
 
189 aa  45.4  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.12225  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1431  hypothetical protein  26.04 
 
 
145 aa  45.4  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000637648  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0908  hypothetical protein  31.96 
 
 
174 aa  45.1  0.0006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000542792  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1247  hypothetical protein  39.33 
 
 
188 aa  45.1  0.0008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1442  hypothetical protein  28.46 
 
 
265 aa  44.3  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.658193  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1180  hypothetical protein  39.73 
 
 
232 aa  44.7  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2248  hypothetical protein  36.23 
 
 
165 aa  42.7  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000924261  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3095  hypothetical protein  39.71 
 
 
214 aa  42.7  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0384  hypothetical protein  45.65 
 
 
202 aa  42.4  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1359  hypothetical protein  29.07 
 
 
182 aa  42.4  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0526065  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1763  hypothetical protein  32.94 
 
 
183 aa  42.4  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.4783800000000001e-18  normal  0.040844 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1038  hypothetical protein  24.43 
 
 
135 aa  42  0.005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3394  hypothetical protein  43.48 
 
 
270 aa  41.6  0.007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.639222  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>