34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0334 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_0334  hydrogenase-1 expression HyaE  100 
 
 		 132 aa  251  2.0000000000000002e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00191534  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2024  hydrogenase-1 expression HyaE  39.58 
 
 		 145 aa  73.6  0.0000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.328634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2001  hydrogenase expression/formation  40.91 
 
 		 148 aa  71.2  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0851794  normal  0.881912 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1291  hydrogenase-1 expression HyaE  37.61 
 
 		 149 aa  68.6  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000102865  normal  0.731428 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0501  HupG hydrogenase expression/formation protein  38.3 
 
 		 128 aa  67.4  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1637  hydrogenase-1 operon protein HyaE2  33.33 
 
 		 136 aa  66.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.569124  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1646  hydrogenase-1 operon protein HyaE2  33.33 
 
 		 136 aa  66.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.769787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1705  hydrogenase-1 operon protein HyaE2  33.33 
 
 		 136 aa  66.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.403477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2152  hydrogenase-1 expression HyaE  37.23 
 
 		 128 aa  66.6  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.136695  normal  0.199969 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2820  hypothetical protein  33.33 
 
 		 170 aa  66.6  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1802  hydrogenase-1 operon protein HyaE2  33.33 
 
 		 136 aa  66.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0548296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1638  hydrogenase-1 operon protein HyaE2  33.33 
 
 		 136 aa  65.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1168  hydrogenase-1 expression HyaE  37.93 
 
 		 134 aa  63.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1160  hydrogenase-1 expression HyaE  36 
 
 		 133 aa  63.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0717414  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3103  hydrogenase-1 expression HyaE  33.61 
 
 		 139 aa  62  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50540  hydrogenase expression/formation protein, HoxO  32.62 
 
 		 148 aa  62  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0130236  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3370  hypothetical protein  35.96 
 
 		 125 aa  61.2  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.485584  normal  0.945167 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3767  hydrogenase-1 expression HyaE  38.78 
 
 		 133 aa  60.8  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.996244 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7260  hydrogenase-1 expression HyaE  30.47 
 
 		 148 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.352807  normal  0.532049 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1969  hydrogenase-1 expression HyaE  36.47 
 
 		 169 aa  58.2  0.00000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3984  hydrogenase-1 expression HyaE  29.6 
 
 		 152 aa  56.2  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2178  hydrogenase-1 expression HyaE  38.46 
 
 		 136 aa  51.6  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.112177  normal  0.189005 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1867  thioredoxin  28.57 
 
 		 106 aa  46.2  0.0001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.115873  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1928  hydrogenase-1 operon protein HyaE  29.59 
 
 		 134 aa  45.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.788328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1476  thioredoxin  31.94 
 
 		 223 aa  45.4  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00459132  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1932  hydrogenase-1 operon protein HyaE  29.59 
 
 		 134 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1344  hydrogenase-1 operon protein HyaE  29.59 
 
 		 134 aa  45.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1528  hydrogenase-1 operon protein HyaE  29.59 
 
 		 134 aa  45.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.537377  normal  0.325234 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1988  hydrogenase-1 operon protein HyaE  28.57 
 
 		 134 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1837  thioredoxin  28.81 
 
 		 110 aa  43.1  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0862  thioredoxin  37.14 
 
 		 102 aa  42.4  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.48028  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2339  hydrogenase-1 operon protein HyaE  28.41 
 
 		 132 aa  42  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2211  thioredoxin  37.14 
 
 		 108 aa  40.8  0.006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0171  thioredoxin  27.06 
 
 		 105 aa  40.4  0.009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.620565  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>