70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1291 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1291  hydrogenase-1 expression HyaE  100 
 
 		 149 aa  301  1.0000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000102865  normal  0.731428 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2820  hypothetical protein  73.08 
 
 		 170 aa  200  6e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1969  hydrogenase-1 expression HyaE  66 
 
 		 169 aa  192  1e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2024  hydrogenase-1 expression HyaE  45.26 
 
 		 145 aa  120  4e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.328634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2001  hydrogenase expression/formation  36.76 
 
 		 148 aa  84.3  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0851794  normal  0.881912 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3103  hydrogenase-1 expression HyaE  38.33 
 
 		 139 aa  82.8  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50540  hydrogenase expression/formation protein, HoxO  36.43 
 
 		 148 aa  80.5  0.000000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0130236  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1168  hydrogenase-1 expression HyaE  37.5 
 
 		 134 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1160  hydrogenase-1 expression HyaE  41.51 
 
 		 133 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0717414  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1638  hydrogenase-1 operon protein HyaE2  36.54 
 
 		 136 aa  71.2  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1802  hydrogenase-1 operon protein HyaE2  35.58 
 
 		 136 aa  69.7  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0548296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1637  hydrogenase-1 operon protein HyaE2  35.58 
 
 		 136 aa  70.1  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.569124  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1646  hydrogenase-1 operon protein HyaE2  35.58 
 
 		 136 aa  69.7  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.769787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1705  hydrogenase-1 operon protein HyaE2  34.62 
 
 		 136 aa  67  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.403477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3984  hydrogenase-1 expression HyaE  34.31 
 
 		 152 aa  66.6  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3370  hypothetical protein  33.88 
 
 		 125 aa  66.2  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.485584  normal  0.945167 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1928  hydrogenase-1 operon protein HyaE  31.19 
 
 		 134 aa  64.7  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.788328  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1344  hydrogenase-1 operon protein HyaE  31.19 
 
 		 134 aa  64.7  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1528  hydrogenase-1 operon protein HyaE  31.19 
 
 		 134 aa  64.7  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.537377  normal  0.325234 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7260  hydrogenase-1 expression HyaE  40.74 
 
 		 148 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.352807  normal  0.532049 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1988  hydrogenase-1 operon protein HyaE  31.19 
 
 		 134 aa  64.7  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1932  hydrogenase-1 operon protein HyaE  31.19 
 
 		 134 aa  64.3  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0334  hydrogenase-1 expression HyaE  37.61 
 
 		 132 aa  62.8  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00191534  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2339  hydrogenase-1 operon protein HyaE  37.74 
 
 		 132 aa  62.4  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1091  hydrogenase-1 operon protein HyaE  36.79 
 
 		 132 aa  60.8  0.000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0975866  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2620  hydrogenase-1 operon protein HyaE  36.79 
 
 		 132 aa  60.8  0.000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.871694  hitchhiker  0.00774525 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1084  hydrogenase-1 operon protein HyaE  36.79 
 
 		 132 aa  60.8  0.000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00986  hypothetical protein  36.79 
 
 		 132 aa  60.8  0.000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.168201  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2668  hydrogenase-1 expression HyaE  36.79 
 
 		 132 aa  60.8  0.000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.174346  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0501  HupG hydrogenase expression/formation protein  31.3 
 
 		 128 aa  61.2  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2152  hydrogenase-1 expression HyaE  31.3 
 
 		 128 aa  60.8  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.136695  normal  0.199969 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00979  protein involved in processing of HyaA and HyaB proteins  36.79 
 
 		 132 aa  60.8  0.000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.158587  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2141  hydrogenase-1 operon protein HyaE  35.85 
 
 		 132 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.270751  normal  0.675617 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1212  hydrogenase-1 operon protein HyaE  36.79 
 
 		 132 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3767  hydrogenase-1 expression HyaE  38.89 
 
 		 133 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.996244 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2256  thioredoxin  37.5 
 
 		 105 aa  45.4  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435277 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0171  thioredoxin  38.18 
 
 		 105 aa  46.2  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.620565  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1867  thioredoxin  30.99 
 
 		 106 aa  46.2  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.115873  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4407  thioredoxin  35.71 
 
 		 113 aa  45.4  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0295  thioredoxin  40.35 
 
 		 104 aa  45.4  0.0003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0921  thioredoxin  34.29 
 
 		 107 aa  44.3  0.0006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000445063  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  34.55 
 
 		 107 aa  43.9  0.0007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1667  thioredoxin  36.36 
 
 		 110 aa  43.9  0.0008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.000000000131883  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0832  thioredoxin  36.84 
 
 		 105 aa  43.5  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0143  thioredoxin  33.33 
 
 		 104 aa  42.4  0.002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2125  thioredoxin  37.04 
 
 		 286 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0183  thioredoxin  33.33 
 
 		 104 aa  42.4  0.002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4035  thioredoxin  36.36 
 
 		 108 aa  42.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0966495  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0510  thioredoxin 1  36.36 
 
 		 108 aa  42.4  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0310601 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0179  thioredoxin  36.36 
 
 		 108 aa  42.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0162  thioredoxin  33.33 
 
 		 104 aa  42.4  0.002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3849  thioredoxin  33.93 
 
 		 108 aa  41.6  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1142  thioredoxin  35.09 
 
 		 104 aa  42  0.003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0836  thioredoxin  35.09 
 
 		 104 aa  41.6  0.004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11511  thioredoxin  34.55 
 
 		 107 aa  41.2  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11661  thioredoxin  34.55 
 
 		 107 aa  41.2  0.005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.113798  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15251  thioredoxin  32.73 
 
 		 107 aa  41.2  0.005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1072  thioredoxin  34.55 
 
 		 107 aa  41.2  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.888152  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1412  thioredoxin  31.58 
 
 		 104 aa  41.2  0.005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0691  thioredoxin  32.73 
 
 		 107 aa  41.2  0.005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11671  thioredoxin  34.55 
 
 		 107 aa  41.2  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2309  thioredoxin  31.58 
 
 		 108 aa  40.8  0.006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000756824  normal  0.11067 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11291  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  32.73 
 
 		 148 aa  40.8  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.554772 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0215  thioredoxin  29.85 
 
 		 105 aa  40.8  0.006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.370161  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2102  thioredoxin  36.17 
 
 		 291 aa  40.8  0.007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2178  hydrogenase-1 expression HyaE  30.08 
 
 		 136 aa  40.8  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.112177  normal  0.189005 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09121  thioredoxin  32.73 
 
 		 107 aa  40.8  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  32.73 
 
 		 107 aa  40.4  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0686  thioredoxin  32 
 
 		 290 aa  40.4  0.008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0034  thioredoxin  30.65 
 
 		 104 aa  40.4  0.008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>