23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2178 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_2178  hydrogenase-1 expression HyaE  100 
 
 		 136 aa  264  2.9999999999999995e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.112177  normal  0.189005 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1155  hydrogenase-1 expression HyaE  46.15 
 
 		 131 aa  89.7  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.585634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3103  hydrogenase-1 expression HyaE  37.9 
 
 		 139 aa  77.4  0.00000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0501  HupG hydrogenase expression/formation protein  38.28 
 
 		 128 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2152  hydrogenase-1 expression HyaE  38.28 
 
 		 128 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.136695  normal  0.199969 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3370  hypothetical protein  37.6 
 
 		 125 aa  72.8  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.485584  normal  0.945167 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50540  hydrogenase expression/formation protein, HoxO  34.43 
 
 		 148 aa  57  0.00000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0130236  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2024  hydrogenase-1 expression HyaE  45.57 
 
 		 145 aa  53.9  0.0000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.328634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2820  hypothetical protein  32.54 
 
 		 170 aa  53.1  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2001  hydrogenase expression/formation  34.15 
 
 		 148 aa  49.7  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0851794  normal  0.881912 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0334  hydrogenase-1 expression HyaE  38.46 
 
 		 132 aa  49.3  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00191534  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1705  hydrogenase-1 operon protein HyaE2  28.09 
 
 		 136 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.403477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7260  hydrogenase-1 expression HyaE  34.31 
 
 		 148 aa  47.4  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.352807  normal  0.532049 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1637  hydrogenase-1 operon protein HyaE2  28.09 
 
 		 136 aa  47.4  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.569124  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1646  hydrogenase-1 operon protein HyaE2  28.09 
 
 		 136 aa  47  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.769787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1802  hydrogenase-1 operon protein HyaE2  28.09 
 
 		 136 aa  47  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0548296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1638  hydrogenase-1 operon protein HyaE2  26.97 
 
 		 136 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1168  hydrogenase-1 expression HyaE  33.72 
 
 		 134 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3984  hydrogenase-1 expression HyaE  34.95 
 
 		 152 aa  43.1  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1160  hydrogenase-1 expression HyaE  32.56 
 
 		 133 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0717414  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1969  hydrogenase-1 expression HyaE  30.4 
 
 		 169 aa  41.6  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1291  hydrogenase-1 expression HyaE  30.08 
 
 		 149 aa  40.8  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000102865  normal  0.731428 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3767  hydrogenase-1 expression HyaE  35.53 
 
 		 133 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.996244 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>