29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1107 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_1107  hypothetical protein  100 
 
 
184 aa  377  1e-104  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000138586 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1478  hypothetical protein  24.04 
 
 
189 aa  58.9  0.00000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.840474  normal  0.345122 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2469  hypothetical protein  28.88 
 
 
186 aa  58.5  0.00000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.456513  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2845  hypothetical protein  23.37 
 
 
185 aa  57.4  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0259997  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1340  hypothetical protein  23.53 
 
 
189 aa  54.3  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00506631  hitchhiker  0.000123504 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1347  hypothetical protein  24.19 
 
 
186 aa  52  0.000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000908641  hitchhiker  0.0000000000414512 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3016  hypothetical protein  24.19 
 
 
186 aa  52  0.000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000842441  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3174  hypothetical protein  24.19 
 
 
186 aa  52  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00025899  hitchhiker  0.00653995 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1203  hypothetical protein  25.13 
 
 
186 aa  52  0.000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.063894  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1947  putative lipoprotein  23.94 
 
 
188 aa  51.6  0.000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00779715 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3031  hypothetical protein  24.19 
 
 
186 aa  51.6  0.000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000103923  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2676  hypothetical protein  26.88 
 
 
185 aa  51.6  0.000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000868105  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06158  hypothetical protein  26.78 
 
 
172 aa  50.8  0.000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1273  hypothetical protein  24.6 
 
 
186 aa  50.8  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000675373  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1202  hypothetical protein  24.6 
 
 
186 aa  50.8  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0005069  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000348  hypothetical protein  27.68 
 
 
172 aa  50.1  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07240  hypothetical protein  22.41 
 
 
181 aa  49.7  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3343  hypothetical protein  24.06 
 
 
186 aa  49.3  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0469  hypothetical protein  24.85 
 
 
174 aa  48.5  0.00006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1240  hypothetical protein  21.69 
 
 
186 aa  48.1  0.00007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.185429 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1528  hypothetical protein  23.62 
 
 
201 aa  47.8  0.00009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4076  hypothetical protein  27.06 
 
 
186 aa  46.6  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1135  hypothetical protein  22.47 
 
 
185 aa  47  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.616749  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1595  hypothetical protein  20.65 
 
 
194 aa  44.7  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0515991  normal  0.107651 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0406  putative lipoprotein  24.39 
 
 
178 aa  44.3  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1006  hypothetical protein  17.34 
 
 
196 aa  42.7  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.230842 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1577  hypothetical protein  24.1 
 
 
191 aa  42.4  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0639  putative lipoprotein  21.13 
 
 
188 aa  42  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0346116  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2678  hypothetical protein  21.93 
 
 
186 aa  41.6  0.006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.019239  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>