24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0815 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_0815  rubrerythrin  100 
 
 
175 aa  360  6e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0377758  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3902  rubrerythrin  32.68 
 
 
323 aa  60.1  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1881  Rubrerythrin  28.05 
 
 
174 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1802  Rubrerythrin  28.3 
 
 
174 aa  58.5  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2075  rubrerythrin  28.93 
 
 
175 aa  57  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.74926  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1320  rubrerythrin  32.48 
 
 
345 aa  56.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.125942 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4784  Rubrerythrin  30.07 
 
 
323 aa  53.9  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.667039  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4102  rubrerythrin  31.37 
 
 
323 aa  52.8  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7128  hypothetical protein  31.06 
 
 
323 aa  51.6  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.532793 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5833  rubrerythrin  29.14 
 
 
325 aa  49.3  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.651985 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1750  rubrerythrin  27.15 
 
 
175 aa  45.4  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.386737 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3443  rubrerythrin  28.1 
 
 
323 aa  45.4  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.815072 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1536  rubrerythrin  31.36 
 
 
151 aa  45.4  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00146194  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3260  rubrerythrin  29.41 
 
 
318 aa  43.9  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7563  protein of unknown function DUF125 transmembrane  36.78 
 
 
322 aa  43.9  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.443476  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1623  hypothetical protein  39.19 
 
 
327 aa  43.1  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.102873  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1266  rubrerythrin  39.19 
 
 
327 aa  42  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2011  hypothetical protein  29.63 
 
 
325 aa  42  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.593636  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0259  rubrerythrin  27.67 
 
 
318 aa  42  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0346688  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2723  rubrerythrin  34.48 
 
 
167 aa  42  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0811811  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2138  hypothetical protein  29.89 
 
 
162 aa  42  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.942475  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1679  hypothetical protein  37.84 
 
 
327 aa  42  0.005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.190638  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0478  hypothetical protein  28.41 
 
 
151 aa  42  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3480  rubrerythrin  34.09 
 
 
327 aa  41.6  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.233561  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>