21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0611 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_0611  hypothetical protein  100 
 
 
107 aa  213  5.9999999999999996e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0674  hypothetical protein  56.07 
 
 
107 aa  126  1.0000000000000001e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00479032  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4763  putative transcriptional regulator  50.5 
 
 
106 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.888831 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4613  putative transcriptional regulator  50.5 
 
 
105 aa  108  3e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.105662  normal  0.212662 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4243  hypothetical protein  50.5 
 
 
105 aa  108  3e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.653157  normal 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6455  putative transcriptional regulator  49.5 
 
 
105 aa  105  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2121  putative transcriptional regulator  47.66 
 
 
108 aa  103  9e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.381813  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4555  hypothetical protein  47.66 
 
 
139 aa  99.4  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0630464  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1308  hypothetical protein  40.59 
 
 
115 aa  93.6  8e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00137445  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3916  putative transcriptional regulator  45.54 
 
 
106 aa  90.9  5e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1244  putative transcriptional regulator  42.16 
 
 
107 aa  87.8  5e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2733  putative addiction module antidote protein  43.3 
 
 
106 aa  87.8  5e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0085  putative transcriptional regulator  45.24 
 
 
106 aa  81.3  0.000000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0133229  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1837  hypothetical protein  35.29 
 
 
112 aa  79.3  0.00000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.487902  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4314  hypothetical protein  45.71 
 
 
168 aa  65.1  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.369054  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2162  putative transcriptional regulator  32.38 
 
 
107 aa  62  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.63856  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2517  putative transcriptional regulator  32.99 
 
 
109 aa  45.4  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.463921 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3598  putative transcriptional regulator  30.69 
 
 
109 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.166769  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3922  putative transcriptional regulator  30.69 
 
 
109 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.120301  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5333  putative transcriptional regulator  31.96 
 
 
109 aa  44.3  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.865145  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3502  putative transcriptional regulator  30.1 
 
 
109 aa  43.9  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.387037  hitchhiker  0.00960025 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>