22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_4613 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_4613  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 105 aa  210  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.105662  normal  0.212662 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4243  hypothetical protein  100 
 
 		 105 aa  210  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.653157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4763  putative transcriptional regulator  95.24 
 
 		 106 aa  203  8e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.888831 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6455  putative transcriptional regulator  85.71 
 
 		 105 aa  184  3e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0674  hypothetical protein  65.35 
 
 		 107 aa  142  1e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00479032  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2121  putative transcriptional regulator  64.08 
 
 		 108 aa  140  6e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.381813  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4555  hypothetical protein  57.43 
 
 		 139 aa  117  7e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0630464  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1308  hypothetical protein  50 
 
 		 115 aa  115  9.999999999999999e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00137445  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3916  putative transcriptional regulator  56.57 
 
 		 106 aa  112  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1837  hypothetical protein  50.5 
 
 		 112 aa  108  3e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.487902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0611  hypothetical protein  50.5 
 
 		 107 aa  108  3e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2733  putative addiction module antidote protein  50.51 
 
 		 106 aa  107  7.000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1244  putative transcriptional regulator  49.51 
 
 		 107 aa  99.8  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0085  putative transcriptional regulator  49.49 
 
 		 106 aa  94.4  4e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0133229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2162  putative transcriptional regulator  46.51 
 
 		 107 aa  76.3  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.63856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4314  hypothetical protein  46.15 
 
 		 168 aa  68.9  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.369054  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5333  putative transcriptional regulator  42.11 
 
 		 109 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.865145  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3502  putative transcriptional regulator  42.11 
 
 		 109 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.387037  hitchhiker  0.00960025 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2517  putative transcriptional regulator  40.98 
 
 		 109 aa  40.8  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.463921 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3922  putative transcriptional regulator  40.98 
 
 		 109 aa  40.8  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.120301  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3598  putative transcriptional regulator  40.98 
 
 		 109 aa  40.8  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.166769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4949  putative transcriptional regulator  45.83 
 
 		 96 aa  40  0.01  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.554909  normal  0.473555 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>