16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2121 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2121  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 108 aa  210  4.9999999999999996e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.381813  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4763  putative transcriptional regulator  66.34 
 
 		 106 aa  142  1e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.888831 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4243  hypothetical protein  64.08 
 
 		 105 aa  140  6e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.653157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4613  putative transcriptional regulator  64.08 
 
 		 105 aa  140  6e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.105662  normal  0.212662 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6455  putative transcriptional regulator  62.38 
 
 		 105 aa  134  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0674  hypothetical protein  57.84 
 
 		 107 aa  134  5e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00479032  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1308  hypothetical protein  49.5 
 
 		 115 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00137445  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4555  hypothetical protein  53.47 
 
 		 139 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0630464  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2733  putative addiction module antidote protein  51 
 
 		 106 aa  106  9.000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3916  putative transcriptional regulator  49.52 
 
 		 106 aa  105  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1837  hypothetical protein  53.26 
 
 		 112 aa  104  4e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.487902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0611  hypothetical protein  47.66 
 
 		 107 aa  103  9e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1244  putative transcriptional regulator  47.57 
 
 		 107 aa  97.8  4e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0085  putative transcriptional regulator  44.86 
 
 		 106 aa  90.5  7e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0133229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2162  putative transcriptional regulator  44.76 
 
 		 107 aa  83.6  9e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.63856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4314  hypothetical protein  48.72 
 
 		 168 aa  72.4  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.369054  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>