31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3916 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_3916  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 106 aa  214  4e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2733  putative addiction module antidote protein  66.98 
 
 		 106 aa  150  7e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1244  putative transcriptional regulator  65.09 
 
 		 107 aa  141  4e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0085  putative transcriptional regulator  61 
 
 		 106 aa  132  1.9999999999999998e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0133229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6455  putative transcriptional regulator  58.59 
 
 		 105 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4763  putative transcriptional regulator  56.31 
 
 		 106 aa  114  6e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.888831 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4243  hypothetical protein  56.57 
 
 		 105 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.653157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4613  putative transcriptional regulator  56.57 
 
 		 105 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.105662  normal  0.212662 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1308  hypothetical protein  49.06 
 
 		 115 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00137445  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2121  putative transcriptional regulator  49.52 
 
 		 108 aa  105  2e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.381813  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1837  hypothetical protein  50 
 
 		 112 aa  102  2e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.487902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2162  putative transcriptional regulator  47.57 
 
 		 107 aa  102  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.63856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0674  hypothetical protein  43.56 
 
 		 107 aa  94.7  4e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00479032  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0611  hypothetical protein  45.54 
 
 		 107 aa  90.9  5e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4555  hypothetical protein  43.14 
 
 		 139 aa  86.7  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0630464  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4314  hypothetical protein  38.1 
 
 		 168 aa  51.6  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.369054  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2957  putative transcriptional regulator  29.25 
 
 		 104 aa  48.9  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.270817  normal  0.731266 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4220  putative transcriptional regulator  29.47 
 
 		 104 aa  45.1  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3350  putative transcriptional regulator  29.79 
 
 		 103 aa  45.1  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.000971437  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4139  putative transcriptional regulator  27.55 
 
 		 107 aa  43.9  0.0007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.071007  normal  0.169565 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0600  hypothetical protein  43.18 
 
 		 137 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.236988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1184  transcriptional regulator  27.37 
 
 		 106 aa  43.5  0.0009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.305511  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36100  transcriptional regulator  28.42 
 
 		 106 aa  43.5  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3502  putative transcriptional regulator  35.37 
 
 		 109 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.387037  hitchhiker  0.00960025 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0276  putative addiction module antidote protein  28.72 
 
 		 100 aa  43.5  0.001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5333  putative transcriptional regulator  35.37 
 
 		 109 aa  42.7  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.865145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2517  putative transcriptional regulator  35.37 
 
 		 109 aa  43.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.463921 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3922  putative transcriptional regulator  35.37 
 
 		 109 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.120301  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3598  putative transcriptional regulator  35.37 
 
 		 109 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.166769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0017  hypothetical protein  28.92 
 
 		 116 aa  41.2  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.447593  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2242  putative transcriptional regulator  30.95 
 
 		 99 aa  41.2  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>