22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_6455 on replicon NC_010518
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010518  Mrad2831_6455  putative transcriptional regulator  100 
 
 
105 aa  210  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4613  putative transcriptional regulator  85.71 
 
 
105 aa  184  3e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.105662  normal  0.212662 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4243  hypothetical protein  85.71 
 
 
105 aa  184  3e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.653157  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4763  putative transcriptional regulator  84.76 
 
 
106 aa  181  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.888831 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0674  hypothetical protein  62.86 
 
 
107 aa  140  6e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00479032  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2121  putative transcriptional regulator  62.38 
 
 
108 aa  134  3.0000000000000003e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.381813  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4555  hypothetical protein  58.1 
 
 
139 aa  121  2e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0630464  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1308  hypothetical protein  50.96 
 
 
115 aa  120  7e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00137445  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3916  putative transcriptional regulator  58.59 
 
 
106 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2733  putative addiction module antidote protein  55.56 
 
 
106 aa  114  5e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1837  hypothetical protein  50.96 
 
 
112 aa  113  1.0000000000000001e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.487902  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0611  hypothetical protein  49.5 
 
 
107 aa  105  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1244  putative transcriptional regulator  52.48 
 
 
107 aa  103  5e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0085  putative transcriptional regulator  51.52 
 
 
106 aa  99.4  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0133229  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2162  putative transcriptional regulator  46.07 
 
 
107 aa  80.5  0.000000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.63856  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4314  hypothetical protein  50 
 
 
168 aa  69.7  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.369054  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3922  putative transcriptional regulator  49.02 
 
 
109 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.120301  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3598  putative transcriptional regulator  49.02 
 
 
109 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.166769  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2517  putative transcriptional regulator  49.02 
 
 
109 aa  43.9  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.463921 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3502  putative transcriptional regulator  51.06 
 
 
109 aa  43.9  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.387037  hitchhiker  0.00960025 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5333  putative transcriptional regulator  51.06 
 
 
109 aa  43.9  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.865145  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4037  putative transcriptional regulator  36.56 
 
 
97 aa  40.4  0.008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.42157 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>