21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0085 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_0085  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 106 aa  213  9e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0133229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1244  putative transcriptional regulator  74.29 
 
 		 107 aa  162  2.0000000000000002e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2733  putative addiction module antidote protein  66 
 
 		 106 aa  142  1e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2162  putative transcriptional regulator  59.41 
 
 		 107 aa  133  9e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.63856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3916  putative transcriptional regulator  61 
 
 		 106 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1308  hypothetical protein  49.06 
 
 		 115 aa  105  1e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00137445  n/a   
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6455  putative transcriptional regulator  51.52 
 
 		 105 aa  99.4  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4763  putative transcriptional regulator  51.89 
 
 		 106 aa  98.6  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.888831 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4613  putative transcriptional regulator  49.49 
 
 		 105 aa  94.4  4e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.105662  normal  0.212662 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4243  hypothetical protein  49.49 
 
 		 105 aa  94.4  4e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.653157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1837  hypothetical protein  46.24 
 
 		 112 aa  92.8  1e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.487902  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2121  putative transcriptional regulator  44.86 
 
 		 108 aa  90.5  7e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.381813  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0674  hypothetical protein  39.62 
 
 		 107 aa  87  7e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00479032  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4555  hypothetical protein  41 
 
 		 139 aa  84  7e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0630464  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0611  hypothetical protein  45.24 
 
 		 107 aa  81.3  0.000000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4314  hypothetical protein  36.07 
 
 		 168 aa  50.8  0.000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.369054  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0600  hypothetical protein  56.82 
 
 		 137 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.236988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4220  putative transcriptional regulator  32.04 
 
 		 104 aa  48.5  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3350  putative transcriptional regulator  31.18 
 
 		 103 aa  45.8  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.000971437  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0276  putative addiction module antidote protein  27.96 
 
 		 100 aa  42.7  0.002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2242  putative transcriptional regulator  27.37 
 
 		 99 aa  40.8  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>