103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B2517 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B2517  putative transcriptional regulator  100 
 
 
109 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.463921 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3598  putative transcriptional regulator  98.17 
 
 
109 aa  210  5.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.166769  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3922  putative transcriptional regulator  98.17 
 
 
109 aa  210  5.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.120301  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3502  putative transcriptional regulator  98.17 
 
 
109 aa  209  1e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.387037  hitchhiker  0.00960025 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5333  putative transcriptional regulator  97.25 
 
 
109 aa  206  6e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.865145  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3002  addiction module antidote protein  50 
 
 
112 aa  93.6  7e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0017  hypothetical protein  43.16 
 
 
116 aa  81.6  0.000000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.447593  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3123  putative transcriptional regulator  53.66 
 
 
103 aa  77  0.00000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0368  addiction module antidote protein  47.25 
 
 
100 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.235004 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1184  transcriptional regulator  48.54 
 
 
106 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.305511  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4139  putative transcriptional regulator  48.54 
 
 
107 aa  74.7  0.0000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.071007  normal  0.169565 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2957  putative transcriptional regulator  48.51 
 
 
104 aa  72.4  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.270817  normal  0.731266 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3350  putative transcriptional regulator  46.53 
 
 
103 aa  72.8  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.000971437  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5375  hypothetical protein  37.37 
 
 
114 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00339875  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4220  putative transcriptional regulator  47.06 
 
 
104 aa  70.9  0.000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36100  transcriptional regulator  44.66 
 
 
106 aa  70.9  0.000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2621  putative transcriptional regulator  38.61 
 
 
150 aa  65.1  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0276  putative addiction module antidote protein  51.72 
 
 
100 aa  62.8  0.000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0456  transcriptional regulator  55.36 
 
 
95 aa  62.8  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2079  putative transcriptional regulator  36.17 
 
 
100 aa  62  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4949  putative transcriptional regulator  47.78 
 
 
96 aa  61.2  0.000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.554909  normal  0.473555 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3155  putative transcriptional regulator  50 
 
 
99 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.239561  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0224  putative transcriptional regulator  41.84 
 
 
95 aa  59.3  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.285215 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1725  putative transcriptional regulator  66.67 
 
 
97 aa  59.3  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.149622  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0282  putative transcriptional regulator  53.57 
 
 
98 aa  58.5  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4018  putative transcriptional regulator  42.39 
 
 
106 aa  58.2  0.00000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1358  putative DNA-binding prophage protein  64.1 
 
 
46 aa  58.2  0.00000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.190658  hitchhiker  0.000534909 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2242  putative transcriptional regulator  51.79 
 
 
99 aa  57.8  0.00000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1424  putative transcriptional regulator  53.57 
 
 
98 aa  57.8  0.00000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.356801  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1734  hypothetical protein  53.57 
 
 
98 aa  57.8  0.00000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2280  transcriptional regulator-like  54.17 
 
 
305 aa  57.4  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.64094  normal  0.372156 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6941  putative transcriptional regulator  40.23 
 
 
99 aa  57  0.00000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.15575  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4548  putative transcriptional regulator  44.71 
 
 
100 aa  57  0.00000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0500  putative transcriptional regulator  40.4 
 
 
100 aa  56.2  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1686  putative transcriptional regulator  42.53 
 
 
98 aa  56.2  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0184  putative transcriptional regulator  37.63 
 
 
94 aa  55.8  0.0000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.57004  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0861  transcriptional regulator  36.7 
 
 
100 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.11203 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2314  putative transcriptional regulator  39.76 
 
 
99 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.92599 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5507  putative transcriptional regulator  40.96 
 
 
99 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.366583  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4952  putative transcriptional regulator  40.96 
 
 
99 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4037  putative transcriptional regulator  47.83 
 
 
97 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.42157 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3672  putative transcriptional regulator  41.46 
 
 
99 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.932392  normal  0.882377 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3926  putative transcriptional regulator  50.88 
 
 
105 aa  53.9  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.511666 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0420  transcriptional regulator  49.32 
 
 
95 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.461361  normal  0.874975 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2670  putative transcriptional regulator  50 
 
 
107 aa  52.8  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.19306  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3174  putative transcriptional regulator  56.25 
 
 
95 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0898  putative transcriptional regulator  39.58 
 
 
96 aa  52.8  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000368951  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40590  transcriptional regulator protein  40.66 
 
 
102 aa  53.1  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3780  putative transcriptional regulator  40.24 
 
 
99 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.798445  normal  0.40275 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0174  putative addiction module antidote protein  35.71 
 
 
95 aa  52  0.000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3743  putative transcriptional regulator  40.24 
 
 
99 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.643331 
 
 
-
 
NC_003296  RS05545  hypothetical protein  42.31 
 
 
99 aa  52  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4583  putative transcriptional regulator  46.27 
 
 
99 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.205891  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1150  hypothetical protein  45.61 
 
 
133 aa  51.6  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6313  addiction module antidote protein  36.96 
 
 
97 aa  51.2  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0276744  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1303  putative transcriptional regulator  37.23 
 
 
96 aa  51.2  0.000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0573  putative transcriptional regulator  33.7 
 
 
101 aa  51.2  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.278814 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8270  putative transcriptional regulator  47.17 
 
 
97 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0213067  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0040  addiction module antidote protein  35.56 
 
 
95 aa  50.4  0.000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1155  putative transcriptional regulator  41.33 
 
 
275 aa  50.1  0.000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00000000163993  unclonable  0.000000164707 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1332  putative transcriptional regulator  40.45 
 
 
99 aa  50.1  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.043655 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1631  hypothetical protein  43.84 
 
 
99 aa  49.3  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.605543  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2537  putative transcriptional regulator  39.58 
 
 
156 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.35922 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1254  putative transcriptional regulator  41.03 
 
 
101 aa  48.5  0.00003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1983  putative transcriptional regulator  46.67 
 
 
94 aa  48.1  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.164326  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0449  hypothetical protein  33.33 
 
 
98 aa  47.4  0.00007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.144343  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9109  hypothetical protein  48.84 
 
 
286 aa  47.4  0.00007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.689253  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1295  putative transcriptional regulator  45.65 
 
 
121 aa  47.4  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.053916  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6535  putative transcriptional regulator  45.65 
 
 
121 aa  47.4  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.322287  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3082  transcriptional regulator  48.84 
 
 
93 aa  47  0.00009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0051  putative transcriptional regulator  43.64 
 
 
92 aa  47  0.00009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0366  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 
104 aa  47  0.00009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2824  addiction module antidote protein  35.44 
 
 
101 aa  47  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.96791  normal  0.589789 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0606  addiction module antidote protein  31.91 
 
 
96 aa  47  0.00009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3881  putative transcriptional regulator  40.68 
 
 
131 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.26577 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2273  putative transcriptional regulator  38.24 
 
 
104 aa  46.6  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.59537  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0171  addiction module antidote protein  45.28 
 
 
107 aa  46.2  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.85634  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0829  hypothetical protein  43.48 
 
 
98 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00761962 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0569  Cro/CI family transcriptional regulator  40.26 
 
 
117 aa  46.2  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0611  hypothetical protein  32.99 
 
 
107 aa  45.4  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0856  putative transcriptional regulator  43.48 
 
 
98 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.18856  normal  0.623315 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2207  putative transcriptional regulator  37.36 
 
 
102 aa  45.8  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3267  addiction module antidote protein  39.71 
 
 
99 aa  46.2  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0570  putative transcriptional regulator  45.1 
 
 
108 aa  45.1  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.266064 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2007  transcriptional regulator  39.22 
 
 
102 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.98827 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0237  putative transcriptional regulator  42.47 
 
 
100 aa  44.7  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1542  Cro/CI family transcriptional regulator  37.89 
 
 
97 aa  44.3  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.395246  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1443  putative transcriptional regulator  39.29 
 
 
97 aa  44.3  0.0005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3989  hypothetical protein  40.74 
 
 
95 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6455  putative transcriptional regulator  49.02 
 
 
105 aa  43.9  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2534  putative transcriptional regulator  38.1 
 
 
98 aa  43.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000050533 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1813  hypothetical protein  45.28 
 
 
118 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0146  addiction module antidote protein  45.28 
 
 
118 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3916  putative transcriptional regulator  35.37 
 
 
106 aa  43.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2993  putative transcriptional regulator  36.84 
 
 
92 aa  43.1  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2877  addiction module antidote protein  38.54 
 
 
97 aa  43.5  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000236023 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0141  putative transcriptional regulator  32.35 
 
 
99 aa  42.7  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.389686  hitchhiker  0.00339535 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3934  putative transcriptional regulator  51.28 
 
 
89 aa  42.7  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.148874 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4763  putative transcriptional regulator  44.26 
 
 
106 aa  42.7  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.888831 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1222  putative transcriptional regulator  39.76 
 
 
98 aa  42  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>