21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_2023 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_2023  hypothetical protein  100 
 
 
259 aa  505  9.999999999999999e-143  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6172  hypothetical protein  30.34 
 
 
255 aa  86.3  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.16698 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0945  hypothetical protein  27.31 
 
 
389 aa  77  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.085357  normal  0.205569 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8249  hypothetical protein  26.29 
 
 
253 aa  68.9  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0455  hypothetical protein  32.05 
 
 
226 aa  67.8  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.184475  normal  0.579054 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3730  hypothetical protein  26.84 
 
 
366 aa  64.3  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4644  hypothetical protein  31.55 
 
 
229 aa  62.4  0.000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2720  hypothetical protein  24.77 
 
 
229 aa  62.4  0.000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.025893  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0597  hypothetical protein  26.41 
 
 
232 aa  62.4  0.000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5596  hypothetical protein  25.69 
 
 
439 aa  61.6  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00840265  normal  0.0208396 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6825  hypothetical protein  26.44 
 
 
268 aa  57.8  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3896  hypothetical protein  27.43 
 
 
405 aa  55.1  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.103005 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2361  hypothetical protein  28.99 
 
 
247 aa  53.5  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0463376  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0897  hypothetical protein  27.98 
 
 
226 aa  52  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.870486  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0849  hypothetical protein  30.29 
 
 
230 aa  50.4  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6370  hypothetical protein  27.22 
 
 
248 aa  50.1  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4353  hypothetical protein  23.33 
 
 
232 aa  45.8  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.442825  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37680  hypothetical protein  23.41 
 
 
270 aa  44.7  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0858561 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3946  hypothetical protein  30.34 
 
 
237 aa  43.9  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.125264 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3186  integrase catalytic region  26.32 
 
 
583 aa  43.1  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.605604  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4985  hypothetical protein  25 
 
 
241 aa  42  0.009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>