More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1647 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_1647  malate dehydrogenase  100 
 
 
504 aa  1002    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0113  malate dehydrogenase  53.22 
 
 
457 aa  448  1.0000000000000001e-124  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.191166  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1376  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  46.78 
 
 
478 aa  435  1e-121  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000390692  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0622  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  53.42 
 
 
460 aa  433  1e-120  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.295745  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2232  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  46.78 
 
 
478 aa  431  1e-119  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1110  malate dehydrogenase  51.03 
 
 
481 aa  429  1e-119  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.421684  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0212  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  50.32 
 
 
500 aa  422  1e-117  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.455099  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2866  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  49.1 
 
 
489 aa  413  1e-114  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1406  malate dehydrogenase  52.6 
 
 
490 aa  414  1e-114  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000179901 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1947  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  51.9 
 
 
470 aa  410  1e-113  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08210  malic enzyme  50.22 
 
 
474 aa  409  1e-113  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0465  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  49.45 
 
 
467 aa  405  1.0000000000000001e-112  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1448  malate dehydrogenase  51.69 
 
 
513 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.320703  normal  0.623093 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4565  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  50.66 
 
 
476 aa  403  1e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.423371  normal  0.479967 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2390  malate dehydrogenase (oxaloacetate decarboxylating)  50.34 
 
 
470 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0366  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  48.32 
 
 
468 aa  400  9.999999999999999e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.697833  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34210  malic enzyme  50.46 
 
 
466 aa  398  1e-109  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1467  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  48.8 
 
 
470 aa  398  1e-109  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0150192  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3355  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  49.66 
 
 
492 aa  397  1e-109  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000240183 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3211  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  49.77 
 
 
481 aa  395  1e-109  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0923  malate dehydrogenase  48.31 
 
 
477 aa  392  1e-108  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.663709  normal  0.827819 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2141  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  46.74 
 
 
474 aa  392  1e-108  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3432  malate dehydrogenase  49.31 
 
 
479 aa  392  1e-108  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.231586  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2803  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  50.57 
 
 
484 aa  389  1e-107  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.533173  hitchhiker  0.00320399 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33400  malic enzyme  48.42 
 
 
473 aa  386  1e-106  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.513398  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2286  malate dehydrogenase  47.75 
 
 
474 aa  386  1e-106  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1195  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  47.46 
 
 
463 aa  387  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.232421 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2034  malate dehydrogenase  49.67 
 
 
461 aa  388  1e-106  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.184863  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10480  malic enzyme  47.15 
 
 
493 aa  384  1e-105  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.549836  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2490  malate dehydrogenase  46.43 
 
 
473 aa  381  1e-104  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.148029  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1706  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  50.34 
 
 
470 aa  377  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.25266 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2458  amino acid-binding ACT  47.37 
 
 
463 aa  378  1e-103  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1656  malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  47.5 
 
 
463 aa  378  1e-103  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.965749  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20210  malic enzyme  46.84 
 
 
485 aa  378  1e-103  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0169  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  56.51 
 
 
387 aa  369  1e-101  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3884  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  49.08 
 
 
466 aa  370  1e-101  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0264  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  50.23 
 
 
461 aa  367  1e-100  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2900  malate dehydrogenase  52.65 
 
 
394 aa  365  1e-100  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0280773  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3983  malate dehydrogenase  45.39 
 
 
462 aa  365  1e-100  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2955  malate dehydrogenase  45.45 
 
 
474 aa  367  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000459536  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0554  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  47.47 
 
 
463 aa  363  3e-99  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.468225  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0980  malate dehydrogenase  50.12 
 
 
464 aa  363  5.0000000000000005e-99  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.428003 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0967  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  47.41 
 
 
407 aa  360  3e-98  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2893  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  43.86 
 
 
463 aa  357  2.9999999999999997e-97  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3203  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  43.86 
 
 
463 aa  357  2.9999999999999997e-97  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1919  malate oxidoreductase  48.25 
 
 
387 aa  356  5.999999999999999e-97  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000616521  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1297  malate dehydrogenase  47.26 
 
 
469 aa  355  1e-96  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.428219  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0409  malate dehydrogenase  52.98 
 
 
403 aa  354  2.9999999999999997e-96  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0492  malate dehydrogenase (malic enzyme) (NAD-malic enzyme)  46.07 
 
 
399 aa  350  4e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0215  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  53.39 
 
 
392 aa  350  4e-95  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.984607  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0490  malate dehydrogenase (malic enzyme) (NAD-malic enzyme)  46.07 
 
 
399 aa  349  6e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0635  putative malate dehydrogenase  46.07 
 
 
399 aa  349  6e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0548  malate dehydrogenase  46.07 
 
 
399 aa  349  7e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0579  malate dehydrogenase  46.07 
 
 
399 aa  349  7e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0617  putative malate dehydrogenase  44.89 
 
 
399 aa  348  1e-94  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1956  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  46.58 
 
 
390 aa  348  1e-94  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4722  putative malate dehydrogenase  45.55 
 
 
399 aa  348  2e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.93198  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0409  malate dehydrogenase  47.8 
 
 
383 aa  347  2e-94  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.192997  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0493  malate dehydrogenase  44.75 
 
 
400 aa  348  2e-94  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8298  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  53.19 
 
 
397 aa  347  3e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.890425  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0499  malate dehydrogenase  47.25 
 
 
401 aa  347  3e-94  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0642  malate dehydrogenase, putative  45.55 
 
 
399 aa  345  8e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3685  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  52.62 
 
 
395 aa  345  1e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0562  malate dehydrogenase (oxaloacetate decarboxylating)  52.07 
 
 
428 aa  343  2.9999999999999997e-93  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3684  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  51.39 
 
 
399 aa  343  5e-93  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.502842  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3529  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  46.14 
 
 
462 aa  340  4e-92  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.411366 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0242  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  50.26 
 
 
414 aa  339  5.9999999999999996e-92  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4173  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  53.74 
 
 
416 aa  339  7e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0140  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  48.4 
 
 
503 aa  339  8e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5158  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  51.61 
 
 
386 aa  338  1.9999999999999998e-91  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.833951  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7700  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  55.75 
 
 
405 aa  337  2.9999999999999997e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0474841  normal  0.880445 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0140  NAD-dependent malic enzyme  48.17 
 
 
390 aa  336  5e-91  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0174768  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3134  putative malate dehydrogenase  46.61 
 
 
414 aa  336  5.999999999999999e-91  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2923  malate dehydrogenase  46.05 
 
 
414 aa  336  7e-91  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.440621  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3145  malate dehydrogenase  46.05 
 
 
414 aa  336  7e-91  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.232361  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0229  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  46.88 
 
 
384 aa  333  4e-90  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1419  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  52.32 
 
 
411 aa  329  6e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2869  malic enzyme  48.98 
 
 
761 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000177126 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1727  malate dehydrogenase  50.13 
 
 
396 aa  328  1.0000000000000001e-88  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.993895  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0547  malic enzyme NAD binding subunit  48.07 
 
 
417 aa  328  2.0000000000000001e-88  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.199377  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0848  malic enzyme  44.72 
 
 
760 aa  327  4.0000000000000003e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0524  putative malate dehydrogenase  46.25 
 
 
412 aa  326  5e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2399  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))  44.29 
 
 
399 aa  325  8.000000000000001e-88  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000325026  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3751  malate dehydrogenase  53.06 
 
 
408 aa  325  8.000000000000001e-88  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.131564  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3213  malic enzyme  47.54 
 
 
759 aa  325  8.000000000000001e-88  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3045  NAD-dependent malic enzyme  47.03 
 
 
427 aa  325  9e-88  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.900825  normal  0.491141 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3292  malic enzyme  46.84 
 
 
759 aa  325  1e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3467  malic enzyme  44.33 
 
 
752 aa  325  1e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0990  malic enzyme  44.42 
 
 
759 aa  325  2e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0830  malate dehydrogenase  46.72 
 
 
403 aa  325  2e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.313277  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0237  malic enzyme  47.58 
 
 
756 aa  324  2e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0395  malate dehydrogenase  44.89 
 
 
376 aa  324  2e-87  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1758  malate dehydrogenase  44.41 
 
 
409 aa  324  3e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0245  malic enzyme  47.58 
 
 
756 aa  324  3e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000009441 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4713  putative malate dehydrogenase  45.99 
 
 
412 aa  323  3e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2788  malic enzyme  45.13 
 
 
756 aa  323  3e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1792  malate dehydrogenase  44.41 
 
 
409 aa  324  3e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0318  malic enzyme  45.13 
 
 
756 aa  323  3e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0298  malic enzyme  45.13 
 
 
756 aa  323  5e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000250182 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0754  malic enzyme  43.9 
 
 
759 aa  323  6e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0943824  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>