More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_1435 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_1435  glutamine synthetase, type I  100 
 
 
437 aa  902    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0643  glutamine synthetase, type I  56.75 
 
 
445 aa  505  9.999999999999999e-143  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.61132  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1297  L-glutamine synthetase  55.68 
 
 
443 aa  491  9.999999999999999e-139  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000250879  normal  0.0655165 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2117  glutamine synthetase, type I  55 
 
 
444 aa  483  1e-135  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1573  glutamine synthetase, type I  54.88 
 
 
445 aa  482  1e-135  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2807  glutamine synthetase, type I  53.41 
 
 
444 aa  480  1e-134  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0737852  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0180  glutamine synthetase, type I  55.53 
 
 
446 aa  478  1e-133  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0666  L-glutamine synthetase  52.27 
 
 
447 aa  477  1e-133  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.57633 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1235  glutamine synthetase, type I  54.09 
 
 
444 aa  478  1e-133  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000016519  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2023  glutamine synthetase, type I  53.21 
 
 
443 aa  475  1e-133  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2490  glutamine synthetase, type I  53.99 
 
 
446 aa  472  1e-132  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.137457 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0386  glutamine synthetase, type I  52.74 
 
 
444 aa  474  1e-132  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2027  glutamine synthetase, type I  54.11 
 
 
443 aa  471  1.0000000000000001e-131  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.123659  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21290  glutamine synthetase, type I  54.46 
 
 
441 aa  470  1.0000000000000001e-131  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0204015  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1975  L-glutamine synthetase  52.4 
 
 
442 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0628  glutamine synthetase, type I  52.28 
 
 
443 aa  470  1.0000000000000001e-131  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0694416  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3760  glutamine synthetase, type I  53.2 
 
 
443 aa  469  1.0000000000000001e-131  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000185172  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3713  glutamine synthetase, type I  52.5 
 
 
444 aa  465  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.53476e-18 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3731  glutamine synthetase, type I  52.73 
 
 
444 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3549  glutamine synthetase, type I  52.5 
 
 
444 aa  465  9.999999999999999e-131  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3449  glutamine synthetase, type I  52.5 
 
 
444 aa  465  9.999999999999999e-131  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3462  glutamate--ammonia ligase (glutamine synthetase, type I)  52.5 
 
 
444 aa  465  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3833  glutamine synthetase, type I  52.5 
 
 
444 aa  465  9.999999999999999e-131  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3754  glutamine synthetase, type I  52.73 
 
 
444 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.149768  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1007  glutamate--ammonia ligase  53.2 
 
 
442 aa  468  9.999999999999999e-131  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000328264  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2381  glutamine synthetase, type I  52.95 
 
 
444 aa  468  9.999999999999999e-131  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3803  glutamine synthetase, type I  52.5 
 
 
444 aa  462  1e-129  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1502  glutamine synthetase, type I  52.5 
 
 
444 aa  462  1e-129  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0398754 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0990  glutamine synthetase, type I  53.72 
 
 
439 aa  463  1e-129  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0186691  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1260  L-glutamine synthetase  51.61 
 
 
461 aa  464  1e-129  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0876  glutamine synthetase FemC  52.64 
 
 
446 aa  459  9.999999999999999e-129  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3469  glutamine synthetase, type I  51.82 
 
 
444 aa  460  9.999999999999999e-129  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00616587  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1394  glutamine synthetase, type I  52.27 
 
 
446 aa  457  1e-127  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.180794  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1368  glutamine synthetase, type I  52.27 
 
 
446 aa  457  1e-127  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0431284  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1123  glutamine synthetase, type I  52.15 
 
 
443 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.245157  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1763  glutamine synthetase, type I  52.48 
 
 
448 aa  452  1.0000000000000001e-126  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.484266  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0962  L-glutamine synthetase  51.71 
 
 
445 aa  454  1.0000000000000001e-126  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0105368  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2389  glutamine synthetase, type I  51.7 
 
 
448 aa  454  1.0000000000000001e-126  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000201555  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0104  L-glutamine synthetase  53.06 
 
 
449 aa  452  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1294  L-glutamine synthetase  51.95 
 
 
444 aa  454  1.0000000000000001e-126  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0180309 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2711  glutamine synthetase, type I  54.04 
 
 
442 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_941  glutamine synthetase, type I  52.38 
 
 
443 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0952  L-glutamine synthetase  51.7 
 
 
443 aa  453  1.0000000000000001e-126  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1389  glutamine synthetase, type I  52.13 
 
 
450 aa  453  1.0000000000000001e-126  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2806  glutamine synthetase, type I  50.34 
 
 
449 aa  454  1.0000000000000001e-126  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3759  glutamine synthetase, type I  54.1 
 
 
444 aa  451  1e-125  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000109487  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1204  glutamine synthetase, type I  50.11 
 
 
452 aa  449  1e-125  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00014918  normal  0.349834 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1751  glutamine synthetase  52.04 
 
 
447 aa  448  1e-125  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0634  glutamine synthetase, type I  50.45 
 
 
444 aa  449  1e-125  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.144254  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4242  glutamine synthetase, type I  51.24 
 
 
446 aa  451  1e-125  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.348488  normal  0.144119 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1837  glutamine synthetase, type I  53.05 
 
 
439 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2374  glutamine synthetase, type I  49.55 
 
 
456 aa  446  1.0000000000000001e-124  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.943832  normal  0.417951 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0261  glutamine synthetase, type I  52.2 
 
 
439 aa  447  1.0000000000000001e-124  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00869904  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0249  glutamine synthetase, type I  51.5 
 
 
433 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.449889  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2273  glutamine synthetase, type I  50.79 
 
 
443 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2135  glutamine synthetase, type I  50.46 
 
 
442 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2099  glutamine synthetase, type I  51.25 
 
 
447 aa  442  1e-123  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1764  L-glutamine synthetase  51.03 
 
 
442 aa  442  1e-123  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.705801  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0779  glutamine synthetase, type I  52.52 
 
 
443 aa  444  1e-123  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.110756  normal  0.217616 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1125  L-glutamine synthetase  50.79 
 
 
443 aa  442  1e-123  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0811977  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0009  glutamine synthetase, type I  51.7 
 
 
447 aa  444  1e-123  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4032  glutamine synthetase, type I  51.58 
 
 
444 aa  443  1e-123  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0782216  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0335  glutamine synthetase, type I  49.65 
 
 
442 aa  443  1e-123  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0032404  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0994  glutamine synthetase, type I  48.18 
 
 
442 aa  439  9.999999999999999e-123  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845982  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5189  glutamine synthetase, type I  50.47 
 
 
451 aa  438  9.999999999999999e-123  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2178  glutamine synthetase, type I  52.86 
 
 
444 aa  437  1e-121  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.588108  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1689  glutamine synthetase, type I  50.46 
 
 
441 aa  437  1e-121  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.394056  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1258  glutamine synthetase, type I  50.11 
 
 
453 aa  432  1e-120  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0380427 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1799  glutamine synthetase, type I  50.8 
 
 
439 aa  432  1e-120  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.743478  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2512  L-glutamine synthetase  52.27 
 
 
446 aa  433  1e-120  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1466  glutamine synthetase, type I  49.21 
 
 
446 aa  434  1e-120  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2270  L-glutamine synthetase  51.15 
 
 
440 aa  434  1e-120  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.327087  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0521  glutamine synthetase, type I  49.66 
 
 
446 aa  434  1e-120  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0952  L-glutamine synthetase  48.06 
 
 
445 aa  429  1e-119  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00098496  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1793  glutamine synthetase, type I  50.46 
 
 
441 aa  431  1e-119  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2648  glutamine synthetase type I  49.11 
 
 
453 aa  429  1e-119  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000984867  normal  0.0179491 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0453  glutamine synthetase, type I  49.21 
 
 
446 aa  431  1e-119  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0952  L-glutamine synthetase  49.1 
 
 
447 aa  427  1e-118  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.434592  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2819  glutamine synthetase, type I  49.55 
 
 
448 aa  426  1e-118  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0770  glutamine synthetase, type I  49.44 
 
 
450 aa  426  1e-118  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00127283 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0150  glutamine synthetase, type I  48.88 
 
 
448 aa  424  1e-117  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.991128  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1202  L-glutamine synthetase  48.04 
 
 
447 aa  422  1e-117  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000336656  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0384  L-glutamine synthetase  47.64 
 
 
446 aa  424  1e-117  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.882152  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3015  glutamine synthetase, type I  48.86 
 
 
450 aa  420  1e-116  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0717  L-glutamine synthetase  47.5 
 
 
448 aa  421  1e-116  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.837857  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1459  glutamine synthetase, type I  47.39 
 
 
451 aa  419  1e-116  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3382  glutamine synthetase, type I  47.95 
 
 
451 aa  416  9.999999999999999e-116  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1700  glutamine synthetase, type I  48.44 
 
 
445 aa  416  9.999999999999999e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1766  glutamine synthetase catalytic region  47.57 
 
 
452 aa  417  9.999999999999999e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.725397  decreased coverage  0.000162709 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1537  glutamine synthetase, type I  48.06 
 
 
456 aa  416  9.999999999999999e-116  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2480  glutamine synthetase, type I  49.31 
 
 
452 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0919  L-glutamine synthetase  48.67 
 
 
453 aa  414  1e-114  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2046  L-glutamine synthetase  47.29 
 
 
455 aa  414  1e-114  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.480104  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0422  glutamine synthetase, type I  50.56 
 
 
444 aa  414  1e-114  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.897308  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0924  glutamine synthetase, type I  48.34 
 
 
453 aa  414  1e-114  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.238729  normal  0.0517431 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3106  glutamine synthetase, type I  49.01 
 
 
453 aa  411  1e-113  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000021484  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2611  glutamine synthetase  48.79 
 
 
453 aa  409  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00742472  normal  0.634853 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0909  glutamine synthetase catalytic region  46.65 
 
 
447 aa  405  1.0000000000000001e-112  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1047  glutamine synthetase, type I  46.61 
 
 
444 aa  407  1.0000000000000001e-112  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3479  glutamine synthetase, type I  46.83 
 
 
444 aa  405  1.0000000000000001e-112  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0194091  hitchhiker  0.0056563 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>