More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0985 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_0985  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  100 
 
 
433 aa  878    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000000205214  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1691  malate dehydrogenase  56.34 
 
 
434 aa  474  1e-132  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.145089  normal  0.0768004 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2233  malate dehydrogenase  55.04 
 
 
434 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.70342  normal  0.683923 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0564  malate dehydrogenase  54.33 
 
 
434 aa  459  9.999999999999999e-129  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0373  malate dehydrogenase  54.57 
 
 
448 aa  446  1.0000000000000001e-124  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0031  malate dehydrogenase  51.33 
 
 
428 aa  425  1e-117  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.399579  normal  0.119769 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0671  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  49.06 
 
 
432 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.13637  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1054  malate dehydrogenase  50.36 
 
 
422 aa  408  1.0000000000000001e-112  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.767504  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2446  malate dehydrogenase  46.82 
 
 
491 aa  404  1e-111  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0229  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  51.94 
 
 
384 aa  387  1e-106  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0642  malate dehydrogenase, putative  49.88 
 
 
399 aa  378  1e-104  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4722  putative malate dehydrogenase  48.78 
 
 
399 aa  380  1e-104  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.93198  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0617  putative malate dehydrogenase  49.38 
 
 
399 aa  379  1e-104  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0548  malate dehydrogenase  49.38 
 
 
399 aa  377  1e-103  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0490  malate dehydrogenase (malic enzyme) (NAD-malic enzyme)  49.63 
 
 
399 aa  376  1e-103  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0492  malate dehydrogenase (malic enzyme) (NAD-malic enzyme)  49.63 
 
 
399 aa  376  1e-103  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0579  malate dehydrogenase  49.38 
 
 
399 aa  377  1e-103  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0635  putative malate dehydrogenase  49.63 
 
 
399 aa  376  1e-103  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1376  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  53.51 
 
 
478 aa  372  1e-102  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000390692  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2232  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  51.13 
 
 
478 aa  371  1e-101  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2923  malate dehydrogenase  49.5 
 
 
414 aa  367  1e-100  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.440621  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3045  NAD-dependent malic enzyme  49.49 
 
 
427 aa  365  1e-100  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.900825  normal  0.491141 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3145  malate dehydrogenase  49.5 
 
 
414 aa  367  1e-100  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.232361  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0902  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))  52.53 
 
 
411 aa  365  1e-100  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0140  NAD-dependent malic enzyme  51.63 
 
 
390 aa  368  1e-100  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0174768  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0409  malate dehydrogenase  49.21 
 
 
383 aa  365  1e-100  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.192997  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3134  putative malate dehydrogenase  49.5 
 
 
414 aa  365  1e-99  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4433  malate dehydrogenase  49.51 
 
 
412 aa  365  1e-99  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1956  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  47.06 
 
 
390 aa  364  2e-99  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0409  malate dehydrogenase  49.14 
 
 
403 aa  364  2e-99  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1919  malate oxidoreductase  50 
 
 
387 aa  363  3e-99  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000616521  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1758  malate dehydrogenase  46.84 
 
 
409 aa  362  6e-99  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1792  malate dehydrogenase  46.84 
 
 
409 aa  362  6e-99  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4713  putative malate dehydrogenase  49.02 
 
 
412 aa  361  1e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1265  NADP-dependent malic enzyme, putative  48.1 
 
 
409 aa  360  2e-98  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0524  putative malate dehydrogenase  49.02 
 
 
412 aa  360  3e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4734  malate dehydrogenase, putative  48.78 
 
 
412 aa  359  4e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4497  malate dehydrogenase  48.78 
 
 
412 aa  359  4e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4332  malate dehydrogenase (malic enzyme, NAD-malic enzyme)  48.78 
 
 
412 aa  359  4e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4729  putative malate dehydrogenase  48.78 
 
 
412 aa  359  4e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1110  malate dehydrogenase  49.62 
 
 
481 aa  359  4e-98  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.421684  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4718  putative malate dehydrogenase  48.78 
 
 
412 aa  359  4e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3287  malate dehydrogenase  49.51 
 
 
412 aa  359  7e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4344  malate dehydrogenase (malic enzyme, NAD-malic enzyme)  48.89 
 
 
402 aa  357  2.9999999999999997e-97  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4848  malate dehydrogenase  48.89 
 
 
402 aa  357  2.9999999999999997e-97  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0493  malate dehydrogenase  49.37 
 
 
400 aa  356  3.9999999999999996e-97  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0215  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  47.49 
 
 
392 aa  355  7.999999999999999e-97  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.984607  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0967  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  47.75 
 
 
407 aa  355  1e-96  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2399  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))  45.69 
 
 
399 aa  354  2e-96  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000325026  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0499  malate dehydrogenase  49.5 
 
 
401 aa  352  7e-96  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2866  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  50.13 
 
 
489 aa  350  2e-95  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0169  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  48.11 
 
 
387 aa  350  3e-95  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0830  malate dehydrogenase  50.79 
 
 
403 aa  349  5e-95  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.313277  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2141  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  50.89 
 
 
474 aa  349  5e-95  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0344  malate dehydrogenase  49.19 
 
 
390 aa  348  7e-95  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.318957  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1534  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))  48.26 
 
 
423 aa  345  1e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0242  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  48.37 
 
 
414 aa  345  1e-93  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2900  malate dehydrogenase  49.35 
 
 
394 aa  340  2e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0280773  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1062  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))  50.63 
 
 
407 aa  338  9.999999999999999e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00425454  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0465  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  49.59 
 
 
467 aa  336  5.999999999999999e-91  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3684  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  50 
 
 
399 aa  335  7.999999999999999e-91  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.502842  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8298  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  50.65 
 
 
397 aa  334  2e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.890425  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0296  malate dehydrogenase  44.21 
 
 
489 aa  333  3e-90  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.491674 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0395  malate dehydrogenase  48.4 
 
 
376 aa  332  7.000000000000001e-90  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0379  malate dehydrogenase  48.4 
 
 
376 aa  332  7.000000000000001e-90  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08210  malic enzyme  49.86 
 
 
474 aa  331  1e-89  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0140  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  47.98 
 
 
503 aa  330  2e-89  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1700  malic enzyme  42.82 
 
 
752 aa  330  3e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3355  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  49.61 
 
 
492 aa  329  5.0000000000000004e-89  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000240183 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0138  malic protein NAD-binding  46.52 
 
 
391 aa  329  6e-89  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000809828  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0401  malate dehydrogenase  48.99 
 
 
407 aa  329  8e-89  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00944416 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2803  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  49.33 
 
 
484 aa  327  2.0000000000000001e-88  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.533173  hitchhiker  0.00320399 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2371  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  47.92 
 
 
405 aa  326  4.0000000000000003e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3211  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  48.51 
 
 
481 aa  325  1e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10480  malic enzyme  49.35 
 
 
493 aa  324  2e-87  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.549836  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0471  malate dehydrogenase  46.15 
 
 
376 aa  323  3e-87  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000122448  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33400  malic enzyme  50.96 
 
 
473 aa  323  5e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.513398  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1912  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  46.55 
 
 
402 aa  323  5e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1637  malic enzyme  41.86 
 
 
752 aa  321  9.999999999999999e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000270094  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2798  malic enzyme  42.56 
 
 
780 aa  321  9.999999999999999e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.272512 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0605  malate dehydrogenase  45.25 
 
 
432 aa  322  9.999999999999999e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0212  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  49.72 
 
 
500 aa  321  9.999999999999999e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.455099  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1406  malate dehydrogenase  50.28 
 
 
490 aa  321  1.9999999999999998e-86  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000179901 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1727  malate dehydrogenase  50.78 
 
 
396 aa  320  1.9999999999999998e-86  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.993895  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2490  malate dehydrogenase  46.48 
 
 
473 aa  320  3e-86  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.148029  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10070  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))  45.78 
 
 
407 aa  320  3.9999999999999996e-86  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000523345  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0246  malic enzyme  41.4 
 
 
776 aa  320  3.9999999999999996e-86  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.838857  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0248  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating) (NADP(+))., Phosphate acetyltransferase  42.19 
 
 
757 aa  319  5e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1560  NADP-dependent malic enzyme  48.43 
 
 
415 aa  319  7e-86  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00518562  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1448  malate dehydrogenase  50.28 
 
 
513 aa  318  7.999999999999999e-86  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.320703  normal  0.623093 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3472  malic enzyme  42.08 
 
 
759 aa  318  7.999999999999999e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.382642  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02354  malic enzyme  42.28 
 
 
759 aa  318  9e-86  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02316  hypothetical protein  42.28 
 
 
759 aa  318  9e-86  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0112  NADP-dependent malic enzyme (NADP-me)  46.94 
 
 
415 aa  318  1e-85  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2609  malic enzyme  42.28 
 
 
759 aa  318  1e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2592  malic enzyme  42.28 
 
 
759 aa  318  1e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1455  malic enzyme  41.86 
 
 
779 aa  318  1e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.163734  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2741  malic enzyme  42.28 
 
 
759 aa  318  1e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1214  malic enzyme  42.28 
 
 
759 aa  318  1e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2829  malic enzyme  42.28 
 
 
759 aa  318  1e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.946085  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>