19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_4156 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_4156  general secretion pathway protein I  100 
 
 
135 aa  271  2.0000000000000002e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000753103 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0684  general secretion pathway protein I  63.93 
 
 
135 aa  148  3e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0270036 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1303  general secretion pathway protein I  42.62 
 
 
134 aa  89.7  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0186089 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1523  putative pseudopilin I precursor  30.4 
 
 
134 aa  55.5  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.261509  normal  0.295629 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0890  hypothetical protein  39.17 
 
 
122 aa  53.5  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000294251  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3147  general secretion pathway protein I, putative  37.33 
 
 
123 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.440076  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2891  general secretion pathway protein H  28.19 
 
 
149 aa  48.1  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.293786  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2534  general secretion pathway protein I  44 
 
 
136 aa  47.8  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0400715  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3313  general secretion pathway protein I, putative  34.57 
 
 
127 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.491657  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2389  general secretion pathway protein I  34.58 
 
 
149 aa  47.4  0.00007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000242378 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2179  general secretion pathway protein GspI  33.59 
 
 
120 aa  47  0.00009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0860  general secretory pathway protein I precursor  33.33 
 
 
132 aa  44.7  0.0004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.1118  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1118  general secretory pathway protein I  33.33 
 
 
139 aa  44.7  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0146  general secretion pathway protein I  35.63 
 
 
130 aa  45.1  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0773  general secretion pathway protein I  34.85 
 
 
132 aa  44.3  0.0005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.258195  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1582  hypothetical protein  31.31 
 
 
209 aa  42  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.152465 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0008  general secretion pathway protein I  35.42 
 
 
121 aa  41.2  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.172677 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0715  hypothetical protein  35.62 
 
 
208 aa  40.8  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.659875  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02680  general secretion pathway protein I  34.21 
 
 
138 aa  40.4  0.008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>