28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0565 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_0565  hypothetical protein  100 
 
 
541 aa  1080    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2815  hypothetical protein  59.28 
 
 
573 aa  586  1e-166  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0638  hypothetical protein  60.87 
 
 
559 aa  572  1.0000000000000001e-162  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.553218  normal  0.0615794 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1451  hypothetical protein  58.58 
 
 
551 aa  574  1.0000000000000001e-162  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1229  hypothetical protein  59.25 
 
 
550 aa  567  1e-160  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.445379 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0997  hypothetical protein  58.13 
 
 
552 aa  563  1.0000000000000001e-159  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3379  hypothetical protein  59.03 
 
 
554 aa  558  1e-158  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.60985  normal  0.431334 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1664  hypothetical protein  55.88 
 
 
574 aa  553  1e-156  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.041747  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2292  hypothetical protein  56.31 
 
 
559 aa  543  1e-153  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0363731  hitchhiker  0.000163049 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4144  hypothetical protein  56.06 
 
 
530 aa  541  1e-153  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.462291  hitchhiker  0.000193551 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1317  hypothetical protein  56.12 
 
 
559 aa  544  1e-153  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.195654  normal  0.119576 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0478  hypothetical protein  52.99 
 
 
574 aa  521  1e-146  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2334  hypothetical protein  71.1 
 
 
552 aa  433  1e-120  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4454  hypothetical protein  44.54 
 
 
575 aa  429  1e-119  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59070  hypothetical protein  44.37 
 
 
579 aa  430  1e-119  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000160429  normal  0.0321205 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1527  hypothetical protein  44.97 
 
 
586 aa  421  1e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.521319  normal  0.116738 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2995  hypothetical protein  44.06 
 
 
528 aa  370  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3287  hypothetical protein  50.3 
 
 
499 aa  291  3e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3746  hypothetical protein  35.48 
 
 
548 aa  254  2.0000000000000002e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0303  hypothetical protein  34.1 
 
 
578 aa  250  5e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000587297 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4114  hypothetical protein  34.42 
 
 
581 aa  238  3e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0608  hypothetical protein  34.61 
 
 
574 aa  233  5e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1348  hypothetical protein  30.76 
 
 
568 aa  227  4e-58  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1721  hypothetical protein  30.76 
 
 
568 aa  225  2e-57  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0642  hypothetical protein  43.03 
 
 
331 aa  175  1.9999999999999998e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0619  hypothetical protein  31.58 
 
 
510 aa  165  2.0000000000000002e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2677  hypothetical protein  27.94 
 
 
569 aa  94.4  5e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.127939  normal  0.454435 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7414  cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.44 
 
 
462 aa  78.2  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>