43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A9601_08341 on replicon NC_008816
Organism: Prochlorococcus marinus str. AS9601



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008816  A9601_08341  hypothetical protein  100 
 
 
182 aa  364  1e-100  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.822121  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08321  hypothetical protein  98.35 
 
 
182 aa  360  5.0000000000000005e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0780  hypothetical protein  95.6 
 
 
182 aa  351  2.9999999999999997e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.388064  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08111  hypothetical protein  85.71 
 
 
182 aa  323  8.000000000000001e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1224  hypothetical protein  50.28 
 
 
186 aa  209  2e-53  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.151569  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1258  hypothetical protein  50.28 
 
 
186 aa  207  9e-53  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0178  hypothetical protein  51.43 
 
 
193 aa  195  3e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_12141  hypothetical protein  54.6 
 
 
186 aa  194  6e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.941538 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08101  hypothetical protein  50.86 
 
 
191 aa  194  7e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0491  hypothetical protein  54.6 
 
 
186 aa  193  1e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.802373  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16901  hypothetical protein  48.11 
 
 
189 aa  189  1e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.381808 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09901  hypothetical protein  42.33 
 
 
165 aa  144  5e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.133858  normal  0.286741 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1669  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  34.13 
 
 
494 aa  94  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1235  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  33.13 
 
 
491 aa  91.3  7e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1265  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  33.13 
 
 
491 aa  91.3  7e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00813231  hitchhiker  0.00210793 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3457  NmrA-like  34.55 
 
 
500 aa  90.5  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.887655  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1529  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  33.33 
 
 
500 aa  87  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.935253 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4104  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  32.34 
 
 
494 aa  83.2  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.185236  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2286  hypothetical protein  31.52 
 
 
493 aa  82.8  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.185851  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2695  hypothetical protein  26.21 
 
 
187 aa  59.7  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49580  predicted protein  33.13 
 
 
247 aa  57.8  0.00000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1737  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  27.46 
 
 
169 aa  57.8  0.00000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1050  hypothetical protein  23.9 
 
 
179 aa  53.5  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.2468  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2484  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  24.42 
 
 
188 aa  53.1  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1613  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  25.44 
 
 
170 aa  53.5  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_17110  predicted protein  27.7 
 
 
212 aa  52.4  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0710818  normal  0.446796 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_36846  predicted protein  28.89 
 
 
216 aa  50.4  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0933  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  32.95 
 
 
195 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1659  hypothetical protein  23.61 
 
 
181 aa  48.1  0.00006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0395297  normal  0.373801 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1910  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  27.27 
 
 
176 aa  45.8  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.111019  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2814  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  29.93 
 
 
178 aa  45.1  0.0006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2934  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  29.93 
 
 
178 aa  45.1  0.0006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.377598 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2794  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  29.93 
 
 
178 aa  45.1  0.0006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2349  hypothetical protein  23.3 
 
 
161 aa  44.7  0.0007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2491  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  27.27 
 
 
178 aa  44.3  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1563  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  29.2 
 
 
174 aa  44.3  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.177112  hitchhiker  0.000729597 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33613  predicted protein  24.36 
 
 
199 aa  42.7  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0895112  normal  0.0480092 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0513  hypothetical protein  32.14 
 
 
166 aa  42.7  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1427  hypothetical protein  28.04 
 
 
174 aa  42.7  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0272472 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1519  hypothetical protein  23.78 
 
 
174 aa  42  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3121  hypothetical protein  27.27 
 
 
174 aa  41.2  0.008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1374  hypothetical protein  27.68 
 
 
174 aa  41.2  0.009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00822959 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05938  conserved hypothetical protein  25.16 
 
 
272 aa  41.2  0.009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>