25 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Mbur_0004  CDS  NC_007955  2416  3129  +  714  50S ribosomal protein L2P  YP_564778  unclonable  0.00000000000000454303  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
 
Mbur_0005  CDS  NC_007955  3146  3559  +  414  30S ribosomal protein S19P  YP_564779  unclonable  1.96004e-16  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0014  CDS  NC_007955  7254  7763  +  510  50S ribosomal protein L5P  YP_564788  unclonable  5.43993e-16  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0015  CDS  NC_007955  7763  7915  +  153  30S ribosomal protein S14P  YP_564789  unclonable  1.67188e-17  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0016  CDS  NC_007955  7927  8319  +  393  30S ribosomal protein S8P  YP_564790  unclonable  1.66957e-16  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0017  CDS  NC_007955  8338  8871  +  534  50S ribosomal protein L6P  YP_564791  unclonable  4.87132e-16  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0080  CDS  NC_007955  69320  70567  -  1248  hypothetical protein  YP_564851  unclonable  0.000000000000412436  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0081  CDS  NC_007955  70587  71309  -  723  ABC transporter, ATPase subunit  YP_564852  unclonable  0.00000000000000360668  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0248  CDS  NC_007955  222529  224283  -  1755  peptidase M50  YP_565005  unclonable  0.0000000000540477  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0686  CDS  NC_007955  705960  706865  +  906  SSU ribosomal protein S6P modification protein  YP_565402  unclonable  0.0000000000000259145  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0858  CDS  NC_007955  901941  904349  +  2409  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit alpha  YP_565559  unclonable  0.00000000764937  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0859  CDS  NC_007955  904352  904867  +  516  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit epsilon  YP_565560  unclonable  8.36594e-16  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0906  CDS  NC_007955  972825  974111  -  1287  putative pseudouridylate synthase  YP_565603  unclonable  0.000000000000179406  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_1039  CDS  NC_007955  1121191  1122660  +  1470  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide synthase (glutamine-hydrolysing) / cobyrinate a,c-diamide synthase  YP_565724  unclonable  0.00000000000825855  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_1092  CDS  NC_007955  1171625  1172239  +  615  hypothetical protein  YP_565772  unclonable  0.00000000000000332806  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_1177  CDS  NC_007955  1264769  1267420  -  2652  DNA-directed RNA polymerase subunit A'  YP_565850  unclonable  0.000000130646  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_1289  CDS  NC_007955  1378083  1380080  -  1998  F420H2 dehydrogenase subunit L  YP_565958  unclonable  0.000000000132103  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_1290  CDS  NC_007955  1380083  1380385  -  303  F420H2 dehydrogenase subunit K  YP_565959  unclonable  7.20191e-17  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_1291    NC_007955  1380385  1380997  -  613      unclonable  9.15748e-16  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_1367  CDS  NC_007955  1458143  1459189  -  1047  transmembrane protein MttP  YP_566034  unclonable  0.0000000000000313497  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_1877  CDS  NC_007955  1973691  1974539  -  849  ribose-phosphate pyrophosphokinase  YP_566510  unclonable  0.0000000000000092442  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_1942  CDS  NC_007955  2039998  2041104  +  1107  cell division protein FtsZ  YP_566573  unclonable  0.000000000000184944  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_1976  CDS  NC_007955  2074844  2078947  +  4104  hypothetical protein  YP_566605  unclonable  0.000800417  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_2045  CDS  NC_007955  2153122  2154162  -  1041  phosphate transporter  YP_566671  unclonable  0.0000000000000973225  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_2049  CDS  NC_007955  2156988  2157296  -  309  translation initiation factor Sui1  YP_566675  unclonable  9.06796e-17  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>