47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene tRNA-Leu-4 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002620  tRNA-Leu-4  tRNA-Leu  100 
 
 		 83 bp  165  2.0000000000000002e-39  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  decreased coverage  0.000953822  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0039  tRNA-Leu  97.37 
 
 		 86 bp  67.9  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Leu-4  tRNA-Leu  97.5 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000432662  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1788  tRNA-Leu  97.22 
 
 		 87 bp  63.9  0.000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.309259  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PGt12  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0043  tRNA-Leu  95 
 
 		 88 bp  56  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00000409272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0011  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 89 bp  54  0.000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.63877 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0027  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 89 bp  54  0.000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0029  tRNA-Leu  94.29 
 
 		 84 bp  54  0.000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.49401  normal  0.597607 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0016  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 86 bp  54  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.460002  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0009  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.207835  normal  0.0298119 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0050  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0866765  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1756  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 89 bp  50.1  0.00008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1979  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 89 bp  50.1  0.00008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1544  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 86 bp  50.1  0.00008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0039  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 87 bp  50.1  0.00008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Leu-3  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 89 bp  50.1  0.00008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.540859  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2244  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 89 bp  48.1  0.0003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2330  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 89 bp  48.1  0.0003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00540389  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0030  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.062405 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0029  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000810076  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0019  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.131414  normal  0.290312 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2098  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0000000256224  hitchhiker  0.00730061 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0046  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000111621  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Leu-5  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0937559  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0023  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.473121  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2681  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000136258  normal  0.046213 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1301  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000334703  hitchhiker  0.000000433032 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1178  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.0000000000000100662  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0049  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000237414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2157  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00076268  hitchhiker  0.000000000132078 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2105  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00000470601  hitchhiker  1.53435e-16 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_R36  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0980  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000163209  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1274  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000000352128  hitchhiker  0.000541618 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0051  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000584609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5037  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000374172  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4669  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.9786200000000003e-18  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00029  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000361603  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0086  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.115514  normal  0.84209 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0068  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0085  tRNA-Leu  92.11 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.196786  normal  0.612491 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0054  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0033  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.44508 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0047  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0001  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0035  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.022075 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>