17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_2724 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_2724  hypothetical protein  100 
 
 		 127 aa  270  4.0000000000000004e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.5774  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3881  P4 alpha zinc-binding domain-containing protein  88.07 
 
 		 929 aa  211  2.9999999999999995e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4007  protein of unknown function DUF927  72.5 
 
 		 899 aa  187  5.999999999999999e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2368  protein of unknown function DUF927  74.07 
 
 		 878 aa  183  8e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.124807  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0680  P4 alpha zinc-binding domain protein  60.75 
 
 		 713 aa  149  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000109484 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0756  hypothetical protein  60.58 
 
 		 711 aa  142  2e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3477  hypothetical protein  29.52 
 
 		 631 aa  52.8  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00832403 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2180  inner membrane protein  33.64 
 
 		 295 aa  52.8  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.541049  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1626  hypothetical protein  26.85 
 
 		 911 aa  50.8  0.000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00166468  normal  0.0358334 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0381  inner membrane protein  31.67 
 
 		 890 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.401126 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4783  zinc-binding domain protein, primase-helicase family  31.67 
 
 		 890 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2819  hypothetical protein  32.69 
 
 		 676 aa  49.3  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.14645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2642  zinc-binding domain of primase-helicase family  33.02 
 
 		 895 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.740754  hitchhiker  0.00000000000696733 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0651  hypothetical protein  30.65 
 
 		 627 aa  47.4  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.19875  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2917  hypothetical protein  27.97 
 
 		 689 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0301646 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1073  hypothetical protein  28.57 
 
 		 591 aa  45.4  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0070  hypothetical protein  27.36 
 
 		 582 aa  40.8  0.007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>