32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_3027 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_3027  membrane protein-like protein  100 
 
 
374 aa  703    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3085  membrane protein-like protein  50.14 
 
 
373 aa  307  2.0000000000000002e-82  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000157468 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04990  predicted membrane protein  47.63 
 
 
365 aa  244  9.999999999999999e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0445  hypothetical protein  41.97 
 
 
369 aa  237  3e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.379085 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3414  hypothetical protein  44.23 
 
 
379 aa  225  1e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0361  hypothetical protein  36.71 
 
 
375 aa  208  1e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0201  hypothetical protein  35.26 
 
 
375 aa  191  2e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01600  hypothetical protein  37.37 
 
 
389 aa  168  1e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4101  membrane protein-like protein  35.61 
 
 
369 aa  161  2e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.453683 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8716  membrane protein-like protein  35.42 
 
 
365 aa  148  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12810  predicted membrane protein  32.23 
 
 
396 aa  145  1e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.157231  decreased coverage  0.00366432 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25710  predicted membrane protein  34.69 
 
 
443 aa  141  1.9999999999999998e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0515  hypothetical protein  35.2 
 
 
388 aa  127  3e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6914  hypothetical protein  35.1 
 
 
359 aa  123  6e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5891  membrane protein-like protein  35.54 
 
 
371 aa  117  3.9999999999999997e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3171  hypothetical protein  33.52 
 
 
378 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2373  membrane protein-like protein  37.7 
 
 
378 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4060  membrane protein-like protein  32.69 
 
 
367 aa  112  1.0000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.270426  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3704  hypothetical protein  36.82 
 
 
366 aa  101  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0978741  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0317  membrane protein-like protein  36.92 
 
 
425 aa  94.7  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0942874  hitchhiker  0.000244181 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0274  membrane protein-like protein  33.43 
 
 
399 aa  95.1  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.024335 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2813  hypothetical protein  34.01 
 
 
431 aa  70.9  0.00000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12591  hypothetical protein  31.17 
 
 
355 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.168318  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0370  hypothetical protein  32.89 
 
 
347 aa  57.8  0.0000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.168954  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0385  hypothetical protein  32.89 
 
 
347 aa  57.8  0.0000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1593  hypothetical protein  37.16 
 
 
176 aa  57  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.419241  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0479  hypothetical protein  29.56 
 
 
347 aa  53.1  0.000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3973  hypothetical protein  29.05 
 
 
341 aa  52.8  0.000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.215582  hitchhiker  0.00962889 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8385  protein of unknown function DUF939  28.93 
 
 
415 aa  50.8  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.652898  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2550  protein of unknown function DUF939  26.32 
 
 
432 aa  46.6  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2072  membrane protein-like protein  33.06 
 
 
419 aa  44.7  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000107578  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2972  membrane protein-like protein  28.36 
 
 
401 aa  42.7  0.009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0211258  normal  0.0161367 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>