22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2455 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_2455  hypothetical protein  100 
 
 
261 aa  521  1e-147  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.928532  normal  0.405844 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3512  hypothetical protein  35.86 
 
 
254 aa  155  6e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3807  hypothetical protein  36.11 
 
 
254 aa  149  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.18849  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2992  putative transmembrane protein  33.33 
 
 
236 aa  144  1e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6348  hypothetical protein  34.86 
 
 
253 aa  135  7e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.291018 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0809  hypothetical protein  37.7 
 
 
253 aa  132  8e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0051  hypothetical protein  30.28 
 
 
252 aa  130  2e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.514774 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0619  hypothetical protein  31.71 
 
 
266 aa  127  2e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0794565 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4081  hypothetical protein  29.81 
 
 
267 aa  125  9e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0344  hypothetical protein  30.08 
 
 
267 aa  123  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.123778  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5340  hypothetical protein  34.27 
 
 
253 aa  121  9e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0236442  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4959  hypothetical protein  34.27 
 
 
253 aa  121  1e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.07643  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5047  hypothetical protein  34.27 
 
 
253 aa  121  1e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.713313  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0153  hypothetical protein  34.83 
 
 
309 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0943  hypothetical protein  25.81 
 
 
260 aa  50.8  2e-05  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2950  hypothetical protein  23.22 
 
 
271 aa  48.5  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2130  hypothetical protein  26.54 
 
 
261 aa  48.1  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.128783  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0576  hypothetical protein  24.75 
 
 
260 aa  47  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3176  hypothetical protein  24.64 
 
 
260 aa  47  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.441176  hitchhiker  0.000145856 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3043  hypothetical protein  25.85 
 
 
275 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2997  hypothetical protein  25.85 
 
 
275 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.322506  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3012  hypothetical protein  25.85 
 
 
265 aa  43.9  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0438797  decreased coverage  0.00331074 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>