More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3371 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007650  BTH_II0686  amidophosphoribosyltransferase  65.5 
 
 
511 aa  670  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.488002  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3860  amidophosphoribosyltransferase  63.33 
 
 
510 aa  663  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3965  amidophosphoribosyltransferase  63.33 
 
 
510 aa  665  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.146016  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2226  amidophosphoribosyltransferase  82.47 
 
 
502 aa  852  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.467921  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3355  amidophosphoribosyltransferase  63.33 
 
 
510 aa  663  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0220372  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2299  amidophosphoribosyltransferase  67.46 
 
 
508 aa  692  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.725008  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4402  amidophosphoribosyltransferase  63.33 
 
 
510 aa  665  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.333421  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2460  amidophosphoribosyltransferase  67.7 
 
 
510 aa  681  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0352966  normal  0.628087 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1688  amidophosphoribosyltransferase  75.84 
 
 
505 aa  793  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0762  amidophosphoribosyltransferase  65.7 
 
 
511 aa  671  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1906  amidophosphoribosyltransferase  66.05 
 
 
506 aa  654  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4769  amidophosphoribosyltransferase  80.68 
 
 
502 aa  834  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.573839  normal  0.111826 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2874  amidophosphoribosyltransferase  65.22 
 
 
516 aa  685  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.352356 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3563  amidophosphoribosyltransferase  63.33 
 
 
510 aa  665  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2118  amidophosphoribosyltransferase  63.53 
 
 
510 aa  665  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.775097  normal  0.196419 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4615  amidophosphoribosyltransferase  65.7 
 
 
510 aa  665  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.257725  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1692  amidophosphoribosyltransferase  65.61 
 
 
511 aa  634  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.387172 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2683  amidophosphoribosyltransferase  83.4 
 
 
501 aa  858  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4381  amidophosphoribosyltransferase  67.42 
 
 
516 aa  670  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.779329  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3371  amidophosphoribosyltransferase  100 
 
 
508 aa  1037  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00440111  normal  0.186489 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0536  amidophosphoribosyltransferase  65.29 
 
 
511 aa  668  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1976  amidophosphoribosyltransferase  69.36 
 
 
511 aa  679  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.399256  normal  0.224002 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2151  amidophosphoribosyltransferase  74.8 
 
 
509 aa  776  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.318494 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1865  amidophosphoribosyltransferase  65.29 
 
 
511 aa  668  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2300  amidophosphoribosyltransferase  65.7 
 
 
511 aa  671  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.990709  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3759  amidophosphoribosyltransferase  82.6 
 
 
500 aa  833  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.041178  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2438  amidophosphoribosyltransferase  65.7 
 
 
511 aa  671  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.107689  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1806  amidophosphoribosyltransferase  67 
 
 
511 aa  687  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.704264  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1607  amidophosphoribosyltransferase  83.96 
 
 
505 aa  869  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1656  amidophosphoribosyltransferase  65.29 
 
 
511 aa  668  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2736  amidophosphoribosyltransferase  82.47 
 
 
502 aa  851  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1092  amidophosphoribosyltransferase  82.32 
 
 
509 aa  851  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.47355 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1863  amidophosphoribosyltransferase  89.02 
 
 
501 aa  912  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.308686  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1714  amidophosphoribosyltransferase  65.29 
 
 
511 aa  668  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.227459  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6835  amidophosphoribosyltransferase  65.02 
 
 
516 aa  685  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.661611  normal  0.513568 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2130  amidophosphoribosyltransferase  67.4 
 
 
511 aa  691  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.176137  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3056  amidophosphoribosyltransferase  64.14 
 
 
511 aa  634  1e-180  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0876  amidophosphoribosyltransferase  62.76 
 
 
505 aa  633  1e-180  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.602615  normal  0.0457402 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1552  amidophosphoribosyltransferase  60.31 
 
 
507 aa  632  1e-180  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.27756  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1043  amidophosphoribosyltransferase  64.6 
 
 
512 aa  625  1e-178  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.603388 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0778  amidophosphoribosyltransferase  66.24 
 
 
512 aa  624  1e-177  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  1.28601e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1908  amidophosphoribosyltransferase  63.35 
 
 
506 aa  619  1e-176  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.60084 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1153  amidophosphoribosyltransferase  58.51 
 
 
506 aa  602  1e-171  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0456137  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1671  amidophosphoribosyltransferase  57.63 
 
 
503 aa  604  1e-171  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.735528  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2489  amidophosphoribosyltransferase  59.76 
 
 
502 aa  602  1e-171  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002879  amidophosphoribosyltransferase  59.52 
 
 
504 aa  602  1e-171  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00031  amidophosphoribosyltransferase  58.82 
 
 
486 aa  598  1e-170  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.486133  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00031  amidophosphoribosyltransferase  58.61 
 
 
486 aa  598  1e-170  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.242446  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03095  amidophosphoribosyltransferase  59.33 
 
 
504 aa  601  1e-170  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0936  amidophosphoribosyltransferase  59.71 
 
 
511 aa  596  1e-169  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00031  amidophosphoribosyltransferase  58.95 
 
 
485 aa  597  1e-169  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.495809  hitchhiker  0.00403524 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1267  amidophosphoribosyltransferase  60.25 
 
 
506 aa  597  1e-169  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0479924  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0808  amidophosphoribosyltransferase  58.45 
 
 
503 aa  596  1e-169  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00031  amidophosphoribosyltransferase  58.51 
 
 
485 aa  595  1e-169  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.763757  normal  0.837003 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0916  amidophosphoribosyltransferase  56.61 
 
 
504 aa  597  1e-169  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.703004  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1331  amidophosphoribosyltransferase  58.3 
 
 
485 aa  595  1e-169  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0004  amidophosphoribosyltransferase  58.19 
 
 
486 aa  591  1e-168  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.259611  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1242  amidophosphoribosyltransferase  59.19 
 
 
504 aa  592  1e-168  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.520504  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1282  amidophosphoribosyltransferase  59.22 
 
 
511 aa  591  1e-168  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.734228  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00031  amidophosphoribosyltransferase  60.63 
 
 
485 aa  594  1e-168  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0525  amidophosphoribosyltransferase  58.53 
 
 
504 aa  594  1e-168  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00168895  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0004  amidophosphoribosyltransferase  60.17 
 
 
485 aa  594  1e-168  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.970099  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00031  amidophosphoribosyltransferase  58.4 
 
 
486 aa  592  1e-168  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1798  amidophosphoribosyltransferase  59.05 
 
 
504 aa  588  1e-167  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.449367  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1103  amidophosphoribosyltransferase  59.63 
 
 
511 aa  590  1e-167  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.414294 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2072  amidophosphoribosyltransferase  59.79 
 
 
504 aa  590  1e-167  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.729582  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3798  amidophosphoribosyltransferase  57.29 
 
 
505 aa  585  1e-166  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3328  amidophosphoribosyltransferase  59.14 
 
 
505 aa  585  1e-166  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1902  amidophosphoribosyltransferase  58.11 
 
 
501 aa  585  1e-166  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34150  amidophosphoribosyltransferase  58.52 
 
 
501 aa  585  1e-166  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3811  amidophosphoribosyltransferase  58.61 
 
 
502 aa  582  1e-165  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1080  amidophosphoribosyltransferase  58.35 
 
 
504 aa  584  1e-165  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1668  amidophosphoribosyltransferase  58.81 
 
 
502 aa  583  1e-165  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.416229  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2711  amidophosphoribosyltransferase  58.61 
 
 
502 aa  580  1e-164  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.966551  normal  0.266296 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2000  amidophosphoribosyltransferase  58.32 
 
 
501 aa  581  1e-164  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.604146  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1534  amidophosphoribosyltransferase  58.52 
 
 
501 aa  580  1e-164  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.609043 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1374  amidophosphoribosyltransferase  58.73 
 
 
505 aa  578  1e-164  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3761  amidophosphoribosyltransferase  58.32 
 
 
501 aa  580  1e-164  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2550  amidophosphoribosyltransferase  57.49 
 
 
505 aa  576  1e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2504  amidophosphoribosyltransferase  57.49 
 
 
505 aa  576  1e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1561  amidophosphoribosyltransferase  57.49 
 
 
501 aa  577  1e-163  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.183865  normal  0.29049 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2604  amidophosphoribosyltransferase  57.49 
 
 
505 aa  576  1e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.841153 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0355  amidophosphoribosyltransferase  57.43 
 
 
505 aa  575  1e-163  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1426  amidophosphoribosyltransferase  57.43 
 
 
505 aa  575  1e-163  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2570  amidophosphoribosyltransferase  56.58 
 
 
505 aa  575  1e-163  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1535  amidophosphoribosyltransferase  57.43 
 
 
505 aa  575  1e-163  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2592  amidophosphoribosyltransferase  57.49 
 
 
505 aa  576  1e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.210187  normal  0.565897 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2713  amidophosphoribosyltransferase  57.49 
 
 
505 aa  576  1e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0617498  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1621  amidophosphoribosyltransferase  57.55 
 
 
504 aa  577  1e-163  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2025  amidophosphoribosyltransferase  57.11 
 
 
501 aa  576  1e-163  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23920  amidophosphoribosyltransferase  57.11 
 
 
501 aa  577  1e-163  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.444651  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1259  amidophosphoribosyltransferase  58.93 
 
 
503 aa  577  1e-163  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1609  amidophosphoribosyltransferase  55.73 
 
 
505 aa  573  1e-162  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2146  amidophosphoribosyltransferase  56.97 
 
 
504 aa  572  1e-162  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2793  amidophosphoribosyltransferase  55.99 
 
 
505 aa  572  1e-162  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2861  amidophosphoribosyltransferase  57.7 
 
 
505 aa  574  1e-162  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.272913  normal  0.276647 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2463  amidophosphoribosyltransferase  58.14 
 
 
505 aa  570  1e-161  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02237  amidophosphoribosyltransferase  58.14 
 
 
505 aa  568  1e-161  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1340  amidophosphoribosyltransferase  58.14 
 
 
505 aa  568  1e-161  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.889803 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2606  amidophosphoribosyltransferase  58.14 
 
 
505 aa  568  1e-161  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>