More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0422 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00611  leucyl-tRNA synthetase  48.35 
 
 		 860 aa  849    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.197817  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2984  leucyl-tRNA synthetase  48.35 
 
 		 860 aa  849    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00147705  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0194  leucyl-tRNA synthetase  41.25 
 
 		 813 aa  666    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.159225  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2209  leucyl-tRNA synthetase  47.18 
 
 		 824 aa  786    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4794  leucyl-tRNA synthetase  55.16 
 
 		 868 aa  987    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.232287 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2339  leucyl-tRNA synthetase  39.73 
 
 		 858 aa  653    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000153257  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3786  leucyl-tRNA synthetase  78.52 
 
 		 888 aa  1418    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1453  leucyl-tRNA synthetase  54.49 
 
 		 887 aa  959    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.721273  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0060  leucyl-tRNA synthetase  42.23 
 
 		 838 aa  708    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2744  leucyl-tRNA synthetase  68.25 
 
 		 877 aa  1196    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.775327 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3917  leucyl-tRNA synthetase  74.01 
 
 		 910 aa  1334    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1722  leucyl-tRNA synthetase  48.53 
 
 		 863 aa  873    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1234  leucyl-tRNA synthetase  41.02 
 
 		 809 aa  664    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4548  leucyl-tRNA synthetase  78.62 
 
 		 897 aa  1449    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1807  leucyl-tRNA synthetase  46.14 
 
 		 877 aa  759    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.807702  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1174  leucyl-tRNA synthetase  48.07 
 
 		 859 aa  862    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4812  leucyl-tRNA synthetase  54.07 
 
 		 868 aa  981    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4637  leucyl-tRNA synthetase  40.72 
 
 		 802 aa  635    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.802633  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4197  leucyl-tRNA synthetase  47.4 
 
 		 859 aa  791    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4490  leucyl-tRNA synthetase  40.72 
 
 		 802 aa  635    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2453  leucyl-tRNA synthetase  64.73 
 
 		 864 aa  1164    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.484774  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1302  leucyl-tRNA synthetase  47.97 
 
 		 823 aa  837    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1301  leucyl-tRNA synthetase  47.52 
 
 		 823 aa  831    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4352  leucyl-tRNA synthetase  53.74 
 
 		 868 aa  982    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.964178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0576  leucyl-tRNA synthetase  48.61 
 
 		 921 aa  859    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.931447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0544  leucyl-tRNA synthetase  57.71 
 
 		 876 aa  1015    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.697697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1861  leucyl-tRNA synthetase  44.81 
 
 		 829 aa  756    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.911399  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0321  leucyl-tRNA synthetase  41.82 
 
 		 862 aa  728    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.955307  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2834  leucyl-tRNA synthetase  66.18 
 
 		 873 aa  1177    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0282  leucyl-tRNA synthetase  41.7 
 
 		 829 aa  666    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2445  leucyl-tRNA synthetase  57.97 
 
 		 857 aa  1010    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00377193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0091  leucyl-tRNA synthetase  45.59 
 
 		 883 aa  745    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.124322 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4936  leucyl-tRNA synthetase  47.72 
 
 		 872 aa  805    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.130078 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3451  leucyl-tRNA synthetase  64.96 
 
 		 913 aa  1167    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2665  leucyl-tRNA synthetase  51.02 
 
 		 819 aa  885    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.364748  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4957  leucyl-tRNA synthetase  53.73 
 
 		 868 aa  961    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0840  leucyl-tRNA synthetase  45.45 
 
 		 847 aa  753    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1413  leucyl-tRNA synthetase  46.84 
 
 		 851 aa  787    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000816015  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3740  leucyl-tRNA synthetase  65.07 
 
 		 864 aa  1141    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0946299 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1106  leucyl-tRNA synthetase  46.54 
 
 		 884 aa  733    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.629487  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1380  leucyl-tRNA synthetase  48.13 
 
 		 875 aa  759    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.922349  normal  0.216701 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2300  leucyl-tRNA synthetase  47.18 
 
 		 824 aa  790    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.284228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2439  leucyl-tRNA synthetase  43.84 
 
 		 829 aa  729    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0479  leucyl-tRNA synthetase  54.39 
 
 		 877 aa  954    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4991  leucyl-tRNA synthetase  40.72 
 
 		 802 aa  635    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1572  leucyl-tRNA synthetase  41.15 
 
 		 822 aa  671    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.940806  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0911  leucyl-tRNA synthetase  40.67 
 
 		 856 aa  691    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.168509  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1920  leucyl-tRNA synthetase  47.86 
 
 		 865 aa  787    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0511  leucyl-tRNA synthetase  57.76 
 
 		 866 aa  1008    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.711035  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3631  leucyl-tRNA synthetase  46.83 
 
 		 862 aa  786    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0568  leucyl-tRNA synthetase  45.6 
 
 		 829 aa  751    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1211  leucyl-tRNA synthetase  64.28 
 
 		 882 aa  1152    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2727  leucyl-tRNA synthetase  42.87 
 
 		 858 aa  676    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.354364  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0385  leucyl-tRNA synthetase  46.29 
 
 		 874 aa  756    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.039423  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3215  leucyl-tRNA synthetase  46.79 
 
 		 848 aa  779    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0506  leucyl-tRNA synthetase  39.64 
 
 		 851 aa  657    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00566899  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0794  leucyl-tRNA synthetase  41.33 
 
 		 829 aa  664    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0411  leucyl-tRNA synthetase  44.95 
 
 		 863 aa  746    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0758  leucyl-tRNA synthetase  77.83 
 
 		 892 aa  1437    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3308  leucyl-tRNA synthetase  47.67 
 
 		 819 aa  829    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0417159 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0284  leucyl-tRNA synthetase  46.48 
 
 		 882 aa  775    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.366179  normal  0.453958 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2155  leucyl-tRNA synthetase  51.99 
 
 		 817 aa  882    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4605  leucyl-tRNA synthetase  78.47 
 
 		 886 aa  1423    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.864694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0576  leucyl-tRNA synthetase  63.68 
 
 		 863 aa  1149    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0797  leucyl-tRNA synthetase  48.41 
 
 		 872 aa  857    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.749816  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0436  leucyl-tRNA synthetase  46.58 
 
 		 878 aa  764    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2344  leucyl-tRNA synthetase  50.8 
 
 		 856 aa  863    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.633045  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0098  leucyl-tRNA synthetase  45.61 
 
 		 878 aa  758    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0566  leucyl-tRNA synthetase  48.59 
 
 		 934 aa  852    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.632616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2973  leucyl-tRNA synthetase  65.91 
 
 		 873 aa  1179    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0232  leucyl-tRNA synthetase  43.89 
 
 		 861 aa  763    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1328  leucyl-tRNA synthetase  43.32 
 
 		 856 aa  711    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0567  leucyl-tRNA synthetase  43.66 
 
 		 819 aa  688    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0791746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0045  leucyl-tRNA synthetase  45.21 
 
 		 857 aa  752    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.269909 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3020  leucyl-tRNA synthetase  46.18 
 
 		 849 aa  743    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.336439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0171  leucyl-tRNA synthetase  65.42 
 
 		 864 aa  1152    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.678775  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3202  leucyl-tRNA synthetase  41.41 
 
 		 817 aa  639    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1566  leucyl-tRNA synthetase  49.83 
 
 		 870 aa  879    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.408978  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3209  leucyl-tRNA synthetase  46.45 
 
 		 871 aa  763    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0104  leucyl-tRNA synthetase  43.89 
 
 		 875 aa  734    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0645  leucyl-tRNA synthetase  40.55 
 
 		 816 aa  644    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1557  leucyl-tRNA synthetase  46.92 
 
 		 860 aa  832    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1704  leucyl-tRNA synthetase  50.72 
 
 		 929 aa  694    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0997  leucyl-tRNA synthetase  48.13 
 
 		 859 aa  861    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.248445  normal  0.169991 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1062  leucyl-tRNA synthetase  48.01 
 
 		 859 aa  858    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0109864 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0400  leucyl-tRNA synthetase  53.36 
 
 		 864 aa  915    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.8894  normal  0.692139 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0705  leucyl-tRNA synthetase  48.58 
 
 		 872 aa  859    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.173652  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1599  leucyl-tRNA synthetase  44.23 
 
 		 824 aa  740    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000190725  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2957  leucyl-tRNA synthetase  45.52 
 
 		 865 aa  755    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0549  leucyl-tRNA synthetase  64.73 
 
 		 864 aa  1143    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.924908  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12230  leucyl-tRNA synthetase  55.39 
 
 		 873 aa  1001    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.726587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2765  leucyl-tRNA synthetase  46.89 
 
 		 844 aa  766    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2582  leucyl-tRNA synthetase  49.55 
 
 		 864 aa  880    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.60297 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2744  leucyl-tRNA synthetase  49.1 
 
 		 864 aa  883    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0654  leucyl-tRNA synthetase  65.42 
 
 		 864 aa  1152    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2084  leucyl-tRNA synthetase  46.06 
 
 		 829 aa  760    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.276133  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0432  leucyl-tRNA synthetase  48.13 
 
 		 859 aa  795    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0302206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1001  leucyl-tRNA synthetase  48.13 
 
 		 859 aa  860    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.355839  normal  0.124376 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1191  leucyl-tRNA synthetase  48.97 
 
 		 859 aa  873    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.663748 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0731  leucyl-tRNA synthetase  42.7 
 
 		 811 aa  684    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.231189  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>